Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
5XVV


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 31 ligands in PDB entry 5XVV. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
GOL
A
501 6GLYCEROL
lig 2
GOL
A
502 6GLYCEROL
lig 3
GOL
A
503 6GLYCEROL
lig 4
GOL
A
504 6GLYCEROL
lig 5
GOL
A
505 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
506 6GLYCEROL
lig 7
GOL
A
507 6GLYCEROL
lig 8
AKG
A
508 102-OXOGLUTARIC ACID
lig 9
BME
A
509 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 10
GOL
B
501 6GLYCEROL
lig 11
GOL
B
502 6GLYCEROL
lig 12
GOL
B
503 6GLYCEROL
lig 13
GOL
B
504 6GLYCEROL
lig 14
GOL
B
505 6GLYCEROL
lig 15
AKG
B
506 102-OXOGLUTARIC ACID
lig 16
BME
B
507 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 17
GOL
C
501 6GLYCEROL
lig 18
GOL
C
502 6GLYCEROL
lig 19
GOL
C
503 6GLYCEROL
lig 20
AKG
C
504 102-OXOGLUTARIC ACID
lig 21
BME
C
505 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 22
BME
D
501 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 23
GOL
E
501 6GLYCEROL
lig 24
GOL
E
502 6GLYCEROL
lig 25
GOL
E
503 6GLYCEROL
lig 26
GOL
E
504 6GLYCEROL
lig 27
BME
E
505 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 28
GOL
F
501 6GLYCEROL
lig 29
GOL
F
502 6GLYCEROL
lig 30
GOL
F
503 6GLYCEROL
lig 31
BME
F
504 4BETA-MERCAPTOETHANOL