Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
5YP4


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 29 ligands in PDB entry 5YP4. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
GOL
A
803 6GLYCEROL
lig 2
GOL
A
804 6GLYCEROL
lig 3
GOL
A
805 6GLYCEROL
lig 4
GOL
A
806 6GLYCEROL
lig 5
LYS
A
801 9LYSINE
lig 6
PRO
A
802 7PROLINE
lig 7
GOL
B
803 6GLYCEROL
lig 8
GOL
B
804 6GLYCEROL
lig 9
GOL
B
805 6GLYCEROL
lig 10
GOL
B
806 6GLYCEROL
lig 11
GOL
B
807 6GLYCEROL
lig 12
GOL
B
808 6GLYCEROL
lig 13
GOL
B
809 6GLYCEROL
lig 14
GOL
B
810 6GLYCEROL
lig 15
GOL
B
811 6GLYCEROL
lig 16
GOL
B
812 6GLYCEROL
lig 17
LYS
B
801 9LYSINE
lig 18
PRO
B
802 7PROLINE
lig 19
LYS
C
801 9LYSINE
lig 20
PRO
C
802 8PROLINE
lig 21
GOL
C
803 6GLYCEROL
lig 22
GOL
C
804 6GLYCEROL
lig 23
GOL
D
803 6GLYCEROL
lig 24
GOL
D
804 6GLYCEROL
lig 25
GOL
D
805 6GLYCEROL
lig 26
GOL
D
806 6GLYCEROL
lig 27
GOL
D
807 6GLYCEROL
lig 28
LYS
D
801 9LYSINE
lig 29
PRO
D
802 7PROLINE