Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
6FDJ


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 66 ligands in PDB entry 6FDJ. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
CU
A
401 1COPPER (II) ION
lig 2
CU
A
402 1COPPER (II) ION
lig 3
CU
A
403 1COPPER (II) ION
lig 4
CU
A
404 1COPPER (II) ION
lig 5
CU
A
405 1COPPER (II) ION
lig 6
GOL
A
406 6GLYCEROL
lig 7
OXY
A
407 2OXYGEN MOLECULE
lig 8
CU
A
408 1COPPER (II) ION
lig 9
CU
A
409 1COPPER (II) ION
lig 10
CU
B
401 1COPPER (II) ION
lig 11
CU
B
402 1COPPER (II) ION
lig 12
OXY
B
403 2OXYGEN MOLECULE
lig 13
CU
B
404 1COPPER (II) ION
lig 14
CU
B
405 1COPPER (II) ION
lig 15
CU
C
401 1COPPER (II) ION
lig 16
CU
D
401 1COPPER (II) ION
lig 17
CU
D
402 1COPPER (II) ION
lig 18
CU
D
403 1COPPER (II) ION
lig 19
CU
D
404 1COPPER (II) ION
lig 20
CU
D
405 1COPPER (II) ION
lig 21
GOL
D
406 6GLYCEROL
lig 22
OXY
D
407 2OXYGEN MOLECULE
lig 23
CU
D
408 1COPPER (II) ION
lig 24
CU
D
409 1COPPER (II) ION
lig 25
CU
E
401 1COPPER (II) ION
lig 26
CU
E
402 1COPPER (II) ION
lig 27
GOL
E
403 6GLYCEROL
lig 28
GOL
E
404 6GLYCEROL
lig 29
CU
E
405 1COPPER (II) ION
lig 30
CU
E
406 1COPPER (II) ION
lig 31
CU
F
401 1COPPER (II) ION
lig 32
GOL
F
402 6GLYCEROL
lig 33
CU
G
401 1COPPER (II) ION
lig 34
CU
G
402 1COPPER (II) ION
lig 35
CU
G
403 1COPPER (II) ION
lig 36
CU
G
404 1COPPER (II) ION
lig 37
GOL
G
405 6GLYCEROL
lig 38
OXY
G
406 2OXYGEN MOLECULE
lig 39
CU
G
407 1COPPER (II) ION
lig 40
CU
G
408 1COPPER (II) ION
lig 41
CU
G
409 1COPPER (II) ION
lig 42
CU
H
401 1COPPER (II) ION
lig 43
CU
H
402 1COPPER (II) ION
lig 44
GOL
H
403 6GLYCEROL
lig 45
CU
H
404 1COPPER (II) ION
lig 46
CU
H
405 1COPPER (II) ION
lig 47
CU
I
401 1COPPER (II) ION
lig 48
GOL
I
402 6GLYCEROL
lig 49
CU
J
401 1COPPER (II) ION
lig 50
CU
J
402 1COPPER (II) ION
lig 51
CU
J
403 1COPPER (II) ION
lig 52
CU
J
404 1COPPER (II) ION
lig 53
CU
J
405 1COPPER (II) ION
lig 54
GOL
J
406 6GLYCEROL
lig 55
GOL
J
407 6GLYCEROL
lig 56
CU
J
408 1COPPER (II) ION
lig 57
OXY
J
409 2OXYGEN MOLECULE
lig 58
CU
J
410 1COPPER (II) ION
lig 59
CU
K
401 1COPPER (II) ION
lig 60
CU
K
402 1COPPER (II) ION
lig 61
GOL
K
403 6GLYCEROL
lig 62
OXY
K
404 2OXYGEN MOLECULE
lig 63
CU
K
405 1COPPER (II) ION
lig 64
CU
K
406 1COPPER (II) ION
lig 65
CU
L
401 1COPPER (II) ION
lig 66
GOL
L
402 6GLYCEROL