Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
6JTD


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 62 ligands in PDB entry 6JTD. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
UDP
A
501 25URIDINE-5'-DIPHOSPHATE
lig 2
EDO
A
502 41,2-ETHANEDIOL
lig 3
EDO
A
503 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
504 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
505 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
506 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
507 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
508 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
509 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
510 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
511 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
A
512 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
A
513 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
A
514 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
A
515 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
A
516 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
A
517 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
A
518 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
A
519 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
A
520 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
A
521 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
EDO
A
522 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
A
523 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
A
524 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
A
525 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
UDP
B
501 25URIDINE-5'-DIPHOSPHATE
lig 27
EDO
B
502 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
B
503 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
B
504 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
EDO
B
505 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
EDO
B
506 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
B
507 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
EDO
B
508 41,2-ETHANEDIOL
lig 34
EDO
B
509 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
B
510 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
B
511 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
B
512 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
B
513 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
B
514 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
EDO
B
515 41,2-ETHANEDIOL
lig 41
EDO
B
516 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
EDO
B
517 41,2-ETHANEDIOL
lig 43
EDO
B
518 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
EDO
B
519 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
EDO
B
520 41,2-ETHANEDIOL
lig 46
EDO
B
521 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
EDO
B
522 41,2-ETHANEDIOL
lig 48
EDO
B
523 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
EDO
B
524 41,2-ETHANEDIOL
lig 50
EDO
B
525 41,2-ETHANEDIOL
lig 51
EDO
B
526 41,2-ETHANEDIOL
lig 52
EDO
B
527 41,2-ETHANEDIOL
lig 53
EDO
B
528 41,2-ETHANEDIOL
lig 54
EDO
B
529 41,2-ETHANEDIOL
lig 55
EDO
B
530 41,2-ETHANEDIOL
lig 56
EDO
B
531 41,2-ETHANEDIOL
lig 57
EDO
B
532 41,2-ETHANEDIOL
lig 58
EDO
B
533 41,2-ETHANEDIOL
lig 59
EDO
B
534 41,2-ETHANEDIOL
lig 60
EDO
B
535 41,2-ETHANEDIOL
lig 61
EDO
B
536 41,2-ETHANEDIOL
lig 62
EDO
B
537 41,2-ETHANEDIOL