Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
6LVS


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 89 ligands in PDB entry 6LVS. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
GOL
A
501 6GLYCEROL
lig 2
GOL
A
502 6GLYCEROL
lig 3
GOL
A
503 6GLYCEROL
lig 4
NA
A
504 1SODIUM ION
lig 5
NA
A
505 1SODIUM ION
lig 6
NA
A
506 1SODIUM ION
lig 7
NA
A
507 1SODIUM ION
lig 8
NA
A
508 1SODIUM ION
lig 9
NA
A
509 1SODIUM ION
lig 10
NA
A
510 1SODIUM ION
lig 11
FMT
A
511 3FORMIC ACID
lig 12
FMT
A
512 3FORMIC ACID
lig 13
BME
A
513 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 14
GOL
B
501 6GLYCEROL
lig 15
GOL
B
502 6GLYCEROL
lig 16
GOL
B
503 6GLYCEROL
lig 17
NA
B
504 1SODIUM ION
lig 18
NA
B
505 1SODIUM ION
lig 19
NA
B
506 1SODIUM ION
lig 20
NA
B
507 1SODIUM ION
lig 21
NA
B
508 1SODIUM ION
lig 22
NA
B
509 1SODIUM ION
lig 23
NA
B
510 1SODIUM ION
lig 24
NA
B
511 1SODIUM ION
lig 25
FMT
B
512 3FORMIC ACID
lig 26
FMT
B
513 3FORMIC ACID
lig 27
FMT
B
514 3FORMIC ACID
lig 28
FMT
B
515 3FORMIC ACID
lig 29
FMT
B
516 3FORMIC ACID
lig 30
FMT
B
517 3FORMIC ACID
lig 31
FMT
B
518 3FORMIC ACID
lig 32
BME
B
519 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 33
BME
B
520 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 34
GOL
C
501 6GLYCEROL
lig 35
GOL
C
502 6GLYCEROL
lig 36
NA
C
503 1SODIUM ION
lig 37
NA
C
504 1SODIUM ION
lig 38
NA
C
505 1SODIUM ION
lig 39
NA
C
506 1SODIUM ION
lig 40
NA
C
507 1SODIUM ION
lig 41
NA
C
508 1SODIUM ION
lig 42
NA
C
509 1SODIUM ION
lig 43
NA
C
510 1SODIUM ION
lig 44
FMT
C
511 3FORMIC ACID
lig 45
FMT
C
512 3FORMIC ACID
lig 46
FMT
C
513 3FORMIC ACID
lig 47
FMT
C
514 3FORMIC ACID
lig 48
FMT
C
515 3FORMIC ACID
lig 49
FMT
C
516 3FORMIC ACID
lig 50
BME
C
517 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 51
BME
C
518 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 52
GOL
D
501 6GLYCEROL
lig 53
GOL
D
502 6GLYCEROL
lig 54
NA
D
503 1SODIUM ION
lig 55
NA
D
504 1SODIUM ION
lig 56
NA
D
505 1SODIUM ION
lig 57
NA
D
506 1SODIUM ION
lig 58
NA
D
507 1SODIUM ION
lig 59
FMT
D
508 3FORMIC ACID
lig 60
FMT
D
509 3FORMIC ACID
lig 61
GOL
E
501 6GLYCEROL
lig 62
GOL
E
502 6GLYCEROL
lig 63
NA
E
503 1SODIUM ION
lig 64
NA
E
504 1SODIUM ION
lig 65
NA
E
505 1SODIUM ION
lig 66
NA
E
506 1SODIUM ION
lig 67
NA
E
507 1SODIUM ION
lig 68
NA
E
508 1SODIUM ION
lig 69
NA
E
509 1SODIUM ION
lig 70
FMT
E
510 3FORMIC ACID
lig 71
FMT
E
511 3FORMIC ACID
lig 72
FMT
E
512 3FORMIC ACID
lig 73
FMT
E
513 3FORMIC ACID
lig 74
FMT
E
514 3FORMIC ACID
lig 75
BME
E
515 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 76
BME
E
516 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 77
BME
E
517 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 78
EDO
E
518 41,2-ETHANEDIOL
lig 79
NA
F
501 1SODIUM ION
lig 80
NA
F
502 1SODIUM ION
lig 81
NA
F
503 1SODIUM ION
lig 82
NA
F
504 1SODIUM ION
lig 83
NA
F
505 1SODIUM ION
lig 84
NA
F
506 1SODIUM ION
lig 85
FMT
F
507 3FORMIC ACID
lig 86
FMT
F
508 3FORMIC ACID
lig 87
FMT
F
509 3FORMIC ACID
lig 88
FMT
F
510 3FORMIC ACID
lig 89
BME
F
511 4BETA-MERCAPTOETHANOL