Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
6A4U


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 69 ligands in PDB entry 6A4U. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
EDO
A
201 41,2-ETHANEDIOL
lig 2
EDO
A
202 41,2-ETHANEDIOL
lig 3
EDO
A
203 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
204 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
205 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
206 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
207 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
208 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
209 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
SO4
A
210 5SULFATE ION
lig 11
SO4
A
211 5SULFATE ION
lig 12
SO4
A
212 5SULFATE ION
lig 13
EDO
B
201 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
B
202 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
B
203 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
B
204 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
B
205 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
B
206 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
B
207 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
SO4
B
208 5SULFATE ION
lig 21
SO4
B
209 5SULFATE ION
lig 22
SO4
B
210 5SULFATE ION
lig 23
CL
B
211 1CHLORIDE ION
lig 24
EDO
C
201 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
C
202 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
C
203 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
EDO
C
204 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
C
205 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
C
206 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
EDO
C
207 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
EDO
C
208 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
C
209 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
EDO
C
210 41,2-ETHANEDIOL
lig 34
SO4
C
211 5SULFATE ION
lig 35
MG
C
212 1MAGNESIUM ION
lig 36
MG
C
213 1MAGNESIUM ION
lig 37
EDO
D
201 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
D
202 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
D
203 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
EDO
D
204 41,2-ETHANEDIOL
lig 41
EDO
D
205 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
SO4
D
206 5SULFATE ION
lig 43
SO4
D
207 5SULFATE ION
lig 44
MG
D
208 1MAGNESIUM ION
lig 45
MG
D
209 1MAGNESIUM ION
lig 46
EDO
E
201 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
EDO
E
202 41,2-ETHANEDIOL
lig 48
EDO
E
203 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
EDO
E
204 41,2-ETHANEDIOL
lig 50
EDO
E
205 41,2-ETHANEDIOL
lig 51
EDO
E
206 41,2-ETHANEDIOL
lig 52
EDO
E
207 41,2-ETHANEDIOL
lig 53
EDO
E
208 41,2-ETHANEDIOL
lig 54
EDO
E
209 41,2-ETHANEDIOL
lig 55
EDO
E
210 41,2-ETHANEDIOL
lig 56
EDO
E
211 41,2-ETHANEDIOL
lig 57
EDO
E
212 41,2-ETHANEDIOL
lig 58
SO4
E
213 5SULFATE ION
lig 59
SO4
E
214 5SULFATE ION
lig 60
EDO
F
201 41,2-ETHANEDIOL
lig 61
EDO
F
202 41,2-ETHANEDIOL
lig 62
EDO
F
203 41,2-ETHANEDIOL
lig 63
EDO
F
204 41,2-ETHANEDIOL
lig 64
EDO
F
205 41,2-ETHANEDIOL
lig 65
EDO
F
206 41,2-ETHANEDIOL
lig 66
EDO
F
207 41,2-ETHANEDIOL
lig 67
SO4
F
208 5SULFATE ION
lig 68
SO4
F
209 5SULFATE ION
lig 69
MG
F
210 1MAGNESIUM ION