Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
6D7J


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 63 ligands in PDB entry 6D7J. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
K
A
901 1POTASSIUM ION
lig 2
GOL
A
902 6GLYCEROL
lig 3
GOL
A
903 6GLYCEROL
lig 4
GOL
A
904 6GLYCEROL
lig 5
GOL
A
905 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
906 6GLYCEROL
lig 7
GOL
A
907 6GLYCEROL
lig 8
GOL
A
908 6GLYCEROL
lig 9
GOL
A
909 6GLYCEROL
lig 10
GOL
A
910 6GLYCEROL
lig 11
GOL
A
911 6GLYCEROL
lig 12
GOL
A
912 6GLYCEROL
lig 13
GOL
A
913 6GLYCEROL
lig 14
PRO
A
914 8PROLINE
lig 15
NA
A
915 1SODIUM ION
lig 16
K
B
901 1POTASSIUM ION
lig 17
GOL
B
902 6GLYCEROL
lig 18
GOL
B
903 6GLYCEROL
lig 19
GOL
B
904 6GLYCEROL
lig 20
GOL
B
905 6GLYCEROL
lig 21
GOL
B
906 6GLYCEROL
lig 22
GOL
B
907 6GLYCEROL
lig 23
GOL
B
908 6GLYCEROL
lig 24
GOL
B
909 6GLYCEROL
lig 25
GOL
B
910 6GLYCEROL
lig 26
GOL
B
911 6GLYCEROL
lig 27
GOL
B
912 6GLYCEROL
lig 28
GOL
B
913 6GLYCEROL
lig 29
GOL
B
914 6GLYCEROL
lig 30
GOL
B
915 6GLYCEROL
lig 31
GOL
B
916 6GLYCEROL
lig 32
GOL
B
917 6GLYCEROL
lig 33
NA
B
918 1SODIUM ION
lig 34
K
C
901 1POTASSIUM ION
lig 35
GOL
C
902 6GLYCEROL
lig 36
GOL
C
903 6GLYCEROL
lig 37
GOL
C
904 6GLYCEROL
lig 38
GOL
C
905 6GLYCEROL
lig 39
GOL
C
906 6GLYCEROL
lig 40
GOL
C
907 6GLYCEROL
lig 41
GOL
C
908 6GLYCEROL
lig 42
GOL
C
909 6GLYCEROL
lig 43
GOL
C
910 6GLYCEROL
lig 44
GOL
C
911 6GLYCEROL
lig 45
GOL
C
912 6GLYCEROL
lig 46
GOL
C
913 6GLYCEROL
lig 47
GOL
C
914 6GLYCEROL
lig 48
GOL
C
915 6GLYCEROL
lig 49
GOL
C
916 6GLYCEROL
lig 50
GOL
C
917 6GLYCEROL
lig 51
GOL
C
918 6GLYCEROL
lig 52
NA
C
919 1SODIUM ION
lig 53
K
D
901 1POTASSIUM ION
lig 54
GOL
D
902 6GLYCEROL
lig 55
GOL
D
903 6GLYCEROL
lig 56
GOL
D
904 6GLYCEROL
lig 57
GOL
D
905 6GLYCEROL
lig 58
GOL
D
906 6GLYCEROL
lig 59
GOL
D
907 6GLYCEROL
lig 60
GOL
D
908 6GLYCEROL
lig 61
GOL
D
909 6GLYCEROL
lig 62
PRO
D
910 8PROLINE
lig 63
NA
D
911 1SODIUM ION