Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
6NW9


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 95 ligands in PDB entry 6NW9. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
CL
A
701 1CHLORIDE ION
lig 2
NA
A
702 1SODIUM ION
lig 3
NA
A
703 1SODIUM ION
lig 4
MG
A
704 1MAGNESIUM ION
lig 5
CO3
A
705 4CARBONATE ION
lig 6
CO3
A
706 4CARBONATE ION
lig 7
GOL
A
707 6GLYCEROL
lig 8
GOL
A
708 6GLYCEROL
lig 9
GOL
A
709 6GLYCEROL
lig 10
GOL
A
710 6GLYCEROL
lig 11
GOL
A
711 6GLYCEROL
lig 12
GOL
A
712 6GLYCEROL
lig 13
GOL
A
713 6GLYCEROL
lig 14
GOL
A
714 6GLYCEROL
lig 15
GOL
A
715 6GLYCEROL
lig 16
GOL
A
716 6GLYCEROL
lig 17
EDO
A
717 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
A
718 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
A
719 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
A
720 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
A
721 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
EDO
A
722 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
A
723 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
A
724 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
A
725 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
A
726 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
PEG
A
727 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 28
PEG
A
728 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 29
PGE
A
729 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 30
PO4
A
730 5PHOSPHATE ION
lig 31
GOL
A
731 6GLYCEROL
lig 32
PO4
A
732 5PHOSPHATE ION
lig 33
GOL
A
733 6GLYCEROL
lig 34
GOL
A
734 6GLYCEROL
lig 35
EDO
A
735 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
CO3
B
701 4CARBONATE ION
lig 37
CL
B
702 1CHLORIDE ION
lig 38
CL
B
703 1CHLORIDE ION
lig 39
NA
B
704 1SODIUM ION
lig 40
GOL
B
705 6GLYCEROL
lig 41
GOL
B
706 6GLYCEROL
lig 42
GOL
B
707 6GLYCEROL
lig 43
GOL
B
708 6GLYCEROL
lig 44
GOL
B
709 6GLYCEROL
lig 45
GOL
B
710 6GLYCEROL
lig 46
GOL
B
711 6GLYCEROL
lig 47
GOL
B
712 6GLYCEROL
lig 48
GOL
B
713 6GLYCEROL
lig 49
GOL
B
714 6GLYCEROL
lig 50
EDO
B
715 41,2-ETHANEDIOL
lig 51
EDO
B
716 41,2-ETHANEDIOL
lig 52
EDO
B
717 41,2-ETHANEDIOL
lig 53
EDO
B
718 41,2-ETHANEDIOL
lig 54
EDO
B
719 41,2-ETHANEDIOL
lig 55
EDO
B
720 41,2-ETHANEDIOL
lig 56
EDO
B
721 41,2-ETHANEDIOL
lig 57
EDO
B
722 41,2-ETHANEDIOL
lig 58
EDO
B
723 41,2-ETHANEDIOL
lig 59
EDO
B
724 41,2-ETHANEDIOL
lig 60
EDO
B
725 41,2-ETHANEDIOL
lig 61
PEG
B
726 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 62
PEG
B
727 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 63
PEG
B
728 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 64
CL
B
729 1CHLORIDE ION
lig 65
EDO
B
730 41,2-ETHANEDIOL
lig 66
CL
C
701 1CHLORIDE ION
lig 67
CL
C
702 1CHLORIDE ION
lig 68
GOL
C
703 6GLYCEROL
lig 69
GOL
C
704 6GLYCEROL
lig 70
GOL
C
705 6GLYCEROL
lig 71
GOL
C
706 6GLYCEROL
lig 72
GOL
C
707 6GLYCEROL
lig 73
GOL
C
708 6GLYCEROL
lig 74
GOL
C
709 6GLYCEROL
lig 75
GOL
C
710 6GLYCEROL
lig 76
GOL
C
711 6GLYCEROL
lig 77
GOL
C
712 6GLYCEROL
lig 78
GOL
C
713 6GLYCEROL
lig 79
EDO
C
714 41,2-ETHANEDIOL
lig 80
EDO
C
715 41,2-ETHANEDIOL
lig 81
EDO
C
716 41,2-ETHANEDIOL
lig 82
EDO
C
717 41,2-ETHANEDIOL
lig 83
EDO
C
718 41,2-ETHANEDIOL
lig 84
EDO
C
719 41,2-ETHANEDIOL
lig 85
EDO
C
720 41,2-ETHANEDIOL
lig 86
EDO
C
721 41,2-ETHANEDIOL
lig 87
EDO
C
722 41,2-ETHANEDIOL
lig 88
EDO
C
723 41,2-ETHANEDIOL
lig 89
EDO
C
724 41,2-ETHANEDIOL
lig 90
EDO
C
725 41,2-ETHANEDIOL
lig 91
EDO
C
726 41,2-ETHANEDIOL
lig 92
EDO
C
727 41,2-ETHANEDIOL
lig 93
EDO
C
728 41,2-ETHANEDIOL
lig 94
EDO
C
729 41,2-ETHANEDIOL
lig 95
PEG
C
730 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER