Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
6SQG


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 78 ligands in PDB entry 6SQG. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
LFA
A
301 12EICOSANE
lig 2
LFA
A
302 10EICOSANE
lig 3
LFA
A
303 12EICOSANE
lig 4
LFA
A
304 12EICOSANE
lig 5
LFA
A
305 8EICOSANE
lig 6
LFA
A
306 6EICOSANE
lig 7
LFA
A
307 6EICOSANE
lig 8
LFA
A
308 5EICOSANE
lig 9
LFA
A
309 16EICOSANE
lig 10
LFA
A
310 6EICOSANE
lig 11
LFA
A
311 16EICOSANE
lig 12
LFA
A
312 7EICOSANE
lig 13
LFA
A
313 12EICOSANE
lig 14
LFA
A
314 6EICOSANE
lig 15
LFA
A
315 5EICOSANE
lig 16
LFA
A
316 5EICOSANE
lig 17
LFA
A
317 5EICOSANE
lig 18
RET
A
318 20RETINAL
lig 19
LFA
B
301 8EICOSANE
lig 20
LFA
B
302 8EICOSANE
lig 21
LFA
B
303 14EICOSANE
lig 22
LFA
B
304 12EICOSANE
lig 23
LFA
B
305 5EICOSANE
lig 24
LFA
B
306 12EICOSANE
lig 25
LFA
B
307 7EICOSANE
lig 26
LFA
B
308 10EICOSANE
lig 27
LFA
B
309 7EICOSANE
lig 28
LFA
B
310 8EICOSANE
lig 29
LFA
B
311 16EICOSANE
lig 30
LFA
B
312 6EICOSANE
lig 31
LFA
B
313 5EICOSANE
lig 32
LFA
B
314 5EICOSANE
lig 33
LFA
B
315 5EICOSANE
lig 34
RET
B
316 20RETINAL
lig 35
LFA
C
301 14EICOSANE
lig 36
LFA
C
302 5EICOSANE
lig 37
LFA
C
303 8EICOSANE
lig 38
LFA
C
304 12EICOSANE
lig 39
LFA
C
305 12EICOSANE
lig 40
LFA
C
306 6EICOSANE
lig 41
LFA
C
307 10EICOSANE
lig 42
LFA
C
308 7EICOSANE
lig 43
LFA
C
309 10EICOSANE
lig 44
LFA
C
310 5EICOSANE
lig 45
LFA
C
311 5EICOSANE
lig 46
LFA
C
312 8EICOSANE
lig 47
LFA
C
313 5EICOSANE
lig 48
LFA
C
314 8EICOSANE
lig 49
RET
C
315 20RETINAL
lig 50
OLB
D
301 16(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL (9Z)-OCTADEC-9-EN
lig 51
LFA
D
302 12EICOSANE
lig 52
LFA
D
303 12EICOSANE
lig 53
LFA
D
304 10EICOSANE
lig 54
LFA
D
305 12EICOSANE
lig 55
LFA
D
306 12EICOSANE
lig 56
LFA
D
307 14EICOSANE
lig 57
LFA
D
308 10EICOSANE
lig 58
LFA
D
309 10EICOSANE
lig 59
LFA
D
310 14EICOSANE
lig 60
LFA
D
311 6EICOSANE
lig 61
LFA
D
312 5EICOSANE
lig 62
RET
D
313 20RETINAL
lig 63
OLB
E
301 16(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL (9Z)-OCTADEC-9-EN
lig 64
LFA
E
302 9EICOSANE
lig 65
LFA
E
303 8EICOSANE
lig 66
LFA
E
304 12EICOSANE
lig 67
LFA
E
305 6EICOSANE
lig 68
LFA
E
306 5EICOSANE
lig 69
LFA
E
307 8EICOSANE
lig 70
LFA
E
308 10EICOSANE
lig 71
LFA
E
309 6EICOSANE
lig 72
LFA
E
310 16EICOSANE
lig 73
LFA
E
311 16EICOSANE
lig 74
LFA
E
312 8EICOSANE
lig 75
LFA
E
313 8EICOSANE
lig 76
LFA
E
314 8EICOSANE
lig 77
LFA
E
315 8EICOSANE
lig 78
RET
E
316 20RETINAL