Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
6V1A


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 25 ligands in PDB entry 6V1A. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
CIR
C
74 11CITRULLINE
lig 2
NAG
A
201 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 3
NAG
A
202 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 4
NAG
B
201 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 5
GOL
B
202 6GLYCEROL
lig 6
GOL
B
203 6GLYCEROL
lig 7
GOL
B
204 6GLYCEROL
lig 8
GOL
B
205 6GLYCEROL
lig 9
GOL
C
101 6GLYCEROL
lig 10
NA
D
301 1SODIUM ION
lig 11
GOL
D
302 6GLYCEROL
lig 12
GOL
D
303 6GLYCEROL
lig 13
GOL
D
304 6GLYCEROL
lig 14
GOL
D
305 6GLYCEROL
lig 15
GOL
D
306 6GLYCEROL
lig 16
GOL
D
307 6GLYCEROL
lig 17
GOL
D
308 6GLYCEROL
lig 18
GOL
D
309 6GLYCEROL
lig 19
GOL
D
310 6GLYCEROL
lig 20
GOL
E
301 6GLYCEROL
lig 21
GOL
E
302 6GLYCEROL
lig 22
GOL
E
303 6GLYCEROL
lig 23
GOL
E
304 6GLYCEROL
lig 24
GOL
E
305 6GLYCEROL
lig 25
GOL
E
306 6GLYCEROL