Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
6VK5


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 37 ligands in PDB entry 6VK5. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
FE
A
801 1FE (III) ION
lig 2
FE
A
802 1FE (III) ION
lig 3
EDO
A
803 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
804 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
805 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
806 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
807 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
808 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
809 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
810 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
811 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
A
812 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
BEZ
A
813 9BENZOIC ACID
lig 14
EDO
B
401 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
B
402 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
B
403 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
C
201 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
D
201 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
D
202 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
FE
E
801 1FE (III) ION
lig 21
FE
E
802 1FE (III) ION
lig 22
EDO
E
803 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
E
804 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
E
805 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
E
806 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
E
807 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
EDO
E
808 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
E
809 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
BEZ
E
810 9BENZOIC ACID
lig 30
CL
E
811 1CHLORIDE ION
lig 31
EDO
F
401 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
F
402 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
EDO
F
403 41,2-ETHANEDIOL
lig 34
EDO
F
404 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
G
201 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
G
202 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
H
201 41,2-ETHANEDIOL