Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
6WBD


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 54 ligands in PDB entry 6WBD. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
LYS
A
601 10LYSINE
lig 2
EDO
A
602 41,2-ETHANEDIOL
lig 3
EDO
A
603 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
604 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
605 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
606 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
607 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
608 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
609 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
610 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
611 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
A
612 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
A
613 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
A
614 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
A
615 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
A
616 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
A
617 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
A
618 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
A
619 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
A
620 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
A
621 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
EDO
A
622 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
A
623 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
A
624 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
A
625 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
A
626 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
EDO
A
627 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
CL
A
628 1CHLORIDE ION
lig 29
EDO
B
1001 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
EDO
B
1002 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
LYS
B
1003 10LYSINE
lig 32
EDO
B
1004 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
EDO
B
1005 41,2-ETHANEDIOL
lig 34
EDO
B
1006 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
B
1007 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
B
1008 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
B
1009 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
B
1010 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
B
1011 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
EDO
B
1012 41,2-ETHANEDIOL
lig 41
EDO
B
1013 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
EDO
B
1014 41,2-ETHANEDIOL
lig 43
EDO
B
1015 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
EDO
B
1016 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
EDO
B
1017 41,2-ETHANEDIOL
lig 46
EDO
B
1018 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
EDO
B
1019 41,2-ETHANEDIOL
lig 48
EDO
B
1020 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
EDO
B
1021 41,2-ETHANEDIOL
lig 50
EDO
B
1022 41,2-ETHANEDIOL
lig 51
EDO
B
1023 41,2-ETHANEDIOL
lig 52
EDO
B
1024 41,2-ETHANEDIOL
lig 53
EDO
B
1025 41,2-ETHANEDIOL
lig 54
CL
B
1026 1CHLORIDE ION