Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
7VD8


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 329 ligands in PDB entry 7VD8. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
ZN
A
201 1ZINC ION
lig 2
ZN
A
202 1ZINC ION
lig 3
ZN
A
203 1ZINC ION
lig 4
ZN
A
204 1ZINC ION
lig 5
ZN
A
205 1ZINC ION
lig 6
NA
A
206 1SODIUM ION
lig 7
ZN
A
207 1ZINC ION
lig 8
ZN
A
208 1ZINC ION
lig 9
ZN
A
209 1ZINC ION
lig 10
NA
A
210 1SODIUM ION
lig 11
ZN
A
211 1ZINC ION
lig 12
ZN
A
212 1ZINC ION
lig 13
ZN
A
213 1ZINC ION
lig 14
ZN
A
214 1ZINC ION
lig 15
NA
A
215 1SODIUM ION
lig 16
ZN
A
216 1ZINC ION
lig 17
ZN
B
201 1ZINC ION
lig 18
ZN
B
202 1ZINC ION
lig 19
ZN
B
203 1ZINC ION
lig 20
ZN
B
204 1ZINC ION
lig 21
ZN
B
205 1ZINC ION
lig 22
NA
B
206 1SODIUM ION
lig 23
ZN
B
207 1ZINC ION
lig 24
ZN
B
208 1ZINC ION
lig 25
ZN
B
209 1ZINC ION
lig 26
NA
B
210 1SODIUM ION
lig 27
ZN
B
211 1ZINC ION
lig 28
ZN
B
212 1ZINC ION
lig 29
ZN
B
213 1ZINC ION
lig 30
ZN
B
214 1ZINC ION
lig 31
ZN
B
215 1ZINC ION
lig 32
NA
B
216 1SODIUM ION
lig 33
ZN
C
201 1ZINC ION
lig 34
ZN
C
202 1ZINC ION
lig 35
ZN
C
203 1ZINC ION
lig 36
ZN
C
204 1ZINC ION
lig 37
ZN
C
205 1ZINC ION
lig 38
NA
C
206 1SODIUM ION
lig 39
ZN
C
207 1ZINC ION
lig 40
ZN
C
208 1ZINC ION
lig 41
ZN
C
209 1ZINC ION
lig 42
NA
C
210 1SODIUM ION
lig 43
ZN
C
211 1ZINC ION
lig 44
ZN
C
212 1ZINC ION
lig 45
ZN
C
213 1ZINC ION
lig 46
ZN
C
214 1ZINC ION
lig 47
NA
C
215 1SODIUM ION
lig 48
ZN
C
216 1ZINC ION
lig 49
ZN
D
201 1ZINC ION
lig 50
ZN
D
202 1ZINC ION
lig 51
ZN
D
203 1ZINC ION
lig 52
ZN
D
204 1ZINC ION
lig 53
ZN
D
205 1ZINC ION
lig 54
NA
D
206 1SODIUM ION
lig 55
ZN
D
207 1ZINC ION
lig 56
ZN
D
208 1ZINC ION
lig 57
ZN
D
209 1ZINC ION
lig 58
NA
D
210 1SODIUM ION
lig 59
ZN
D
211 1ZINC ION
lig 60
ZN
D
212 1ZINC ION
lig 61
ZN
D
213 1ZINC ION
lig 62
ZN
D
214 1ZINC ION
lig 63
NA
D
215 1SODIUM ION
lig 64
ZN
E
201 1ZINC ION
lig 65
ZN
E
202 1ZINC ION
lig 66
ZN
E
203 1ZINC ION
lig 67
ZN
E
204 1ZINC ION
lig 68
NA
E
205 1SODIUM ION
lig 69
ZN
E
206 1ZINC ION
lig 70
ZN
E
207 1ZINC ION
lig 71
ZN
E
208 1ZINC ION
lig 72
NA
E
209 1SODIUM ION
lig 73
ZN
E
210 1ZINC ION
lig 74
ZN
E
211 1ZINC ION
lig 75
ZN
E
212 1ZINC ION
lig 76
NA
E
213 1SODIUM ION
lig 77
ZN
E
214 1ZINC ION
lig 78
NA
E
215 1SODIUM ION
lig 79
NA
F
201 1SODIUM ION
lig 80
ZN
F
202 1ZINC ION
lig 81
ZN
F
203 1ZINC ION
lig 82
NA
F
204 1SODIUM ION
lig 83
ZN
F
205 1ZINC ION
lig 84
ZN
F
206 1ZINC ION
lig 85
ZN
F
207 1ZINC ION
lig 86
ZN
F
208 1ZINC ION
lig 87
ZN
F
209 1ZINC ION
lig 88
ZN
F
210 1ZINC ION
lig 89
ZN
F
211 1ZINC ION
lig 90
ZN
F
212 1ZINC ION
lig 91
ZN
F
213 1ZINC ION
lig 92
NA
F
214 1SODIUM ION
lig 93
NA
G
201 1SODIUM ION
lig 94
ZN
G
202 1ZINC ION
lig 95
ZN
G
203 1ZINC ION
lig 96
ZN
G
204 1ZINC ION
lig 97
ZN
G
205 1ZINC ION
lig 98
ZN
G
206 1ZINC ION
lig 99
NA
G
207 1SODIUM ION
lig 100
ZN
G
208 1ZINC ION
lig 101
ZN
G
209 1ZINC ION
lig 102
NA
G
210 1SODIUM ION
lig 103
ZN
G
211 1ZINC ION
lig 104
ZN
G
212 1ZINC ION
lig 105
NA
G
213 1SODIUM ION
lig 106
ZN
G
214 1ZINC ION
lig 107
ZN
H
201 1ZINC ION
lig 108
ZN
H
202 1ZINC ION
lig 109
ZN
H
203 1ZINC ION
lig 110
ZN
H
204 1ZINC ION
lig 111
ZN
H
205 1ZINC ION
lig 112
NA
H
206 1SODIUM ION
lig 113
ZN
H
207 1ZINC ION
lig 114
ZN
H
208 1ZINC ION
lig 115
ZN
H
209 1ZINC ION
lig 116
NA
H
210 1SODIUM ION
lig 117
ZN
H
211 1ZINC ION
lig 118
ZN
H
212 1ZINC ION
lig 119
ZN
H
213 1ZINC ION
lig 120
NA
H
214 1SODIUM ION
lig 121
ZN
I
201 1ZINC ION
lig 122
ZN
I
202 1ZINC ION
lig 123
ZN
I
203 1ZINC ION
lig 124
ZN
I
204 1ZINC ION
lig 125
NA
I
205 1SODIUM ION
lig 126
ZN
I
206 1ZINC ION
lig 127
ZN
I
207 1ZINC ION
lig 128
ZN
I
208 1ZINC ION
lig 129
NA
I
209 1SODIUM ION
lig 130
ZN
I
210 1ZINC ION
lig 131
ZN
I
211 1ZINC ION
lig 132
ZN
I
212 1ZINC ION
lig 133
NA
I
213 1SODIUM ION
lig 134
ZN
I
214 1ZINC ION
lig 135
NA
I
215 1SODIUM ION
lig 136
ZN
I
216 1ZINC ION
lig 137
ZN
J
201 1ZINC ION
lig 138
NA
J
202 1SODIUM ION
lig 139
ZN
J
203 1ZINC ION
lig 140
ZN
J
204 1ZINC ION
lig 141
NA
J
205 1SODIUM ION
lig 142
ZN
J
206 1ZINC ION
lig 143
ZN
J
207 1ZINC ION
lig 144
ZN
J
208 1ZINC ION
lig 145
ZN
J
209 1ZINC ION
lig 146
ZN
J
210 1ZINC ION
lig 147
ZN
J
211 1ZINC ION
lig 148
ZN
J
212 1ZINC ION
lig 149
ZN
J
213 1ZINC ION
lig 150
NA
J
214 1SODIUM ION
lig 151
NA
K
201 1SODIUM ION
lig 152
ZN
K
202 1ZINC ION
lig 153
ZN
K
203 1ZINC ION
lig 154
ZN
K
204 1ZINC ION
lig 155
ZN
K
205 1ZINC ION
lig 156
ZN
K
206 1ZINC ION
lig 157
NA
K
207 1SODIUM ION
lig 158
ZN
K
208 1ZINC ION
lig 159
ZN
K
209 1ZINC ION
lig 160
NA
K
210 1SODIUM ION
lig 161
ZN
K
211 1ZINC ION
lig 162
ZN
K
212 1ZINC ION
lig 163
NA
K
213 1SODIUM ION
lig 164
ZN
K
214 1ZINC ION
lig 165
ZN
K
215 1ZINC ION
lig 166
ZN
L
201 1ZINC ION
lig 167
ZN
L
202 1ZINC ION
lig 168
ZN
L
203 1ZINC ION
lig 169
ZN
L
204 1ZINC ION
lig 170
NA
L
205 1SODIUM ION
lig 171
ZN
L
206 1ZINC ION
lig 172
ZN
L
207 1ZINC ION
lig 173
ZN
L
208 1ZINC ION
lig 174
NA
L
209 1SODIUM ION
lig 175
ZN
L
210 1ZINC ION
lig 176
ZN
L
211 1ZINC ION
lig 177
ZN
L
212 1ZINC ION
lig 178
NA
L
213 1SODIUM ION
lig 179
ZN
L
214 1ZINC ION
lig 180
NA
L
215 1SODIUM ION
lig 181
NA
M
201 1SODIUM ION
lig 182
ZN
M
202 1ZINC ION
lig 183
ZN
M
203 1ZINC ION
lig 184
ZN
M
204 1ZINC ION
lig 185
ZN
M
205 1ZINC ION
lig 186
ZN
M
206 1ZINC ION
lig 187
NA
M
207 1SODIUM ION
lig 188
ZN
M
208 1ZINC ION
lig 189
ZN
M
209 1ZINC ION
lig 190
NA
M
210 1SODIUM ION
lig 191
ZN
M
211 1ZINC ION
lig 192
NA
M
212 1SODIUM ION
lig 193
ZN
M
213 1ZINC ION
lig 194
ZN
M
214 1ZINC ION
lig 195
NA
N
201 1SODIUM ION
lig 196
ZN
N
202 1ZINC ION
lig 197
ZN
N
203 1ZINC ION
lig 198
NA
N
204 1SODIUM ION
lig 199
ZN
N
205 1ZINC ION
lig 200
ZN
N
206 1ZINC ION
lig 201
ZN
N
207 1ZINC ION
lig 202
ZN
N
208 1ZINC ION
lig 203
ZN
N
209 1ZINC ION
lig 204
ZN
N
210 1ZINC ION
lig 205
ZN
N
211 1ZINC ION
lig 206
ZN
N
212 1ZINC ION
lig 207
NA
N
213 1SODIUM ION
lig 208
ZN
O
201 1ZINC ION
lig 209
NA
O
202 1SODIUM ION
lig 210
ZN
O
203 1ZINC ION
lig 211
ZN
O
204 1ZINC ION
lig 212
ZN
O
205 1ZINC ION
lig 213
ZN
O
206 1ZINC ION
lig 214
NA
O
207 1SODIUM ION
lig 215
ZN
O
208 1ZINC ION
lig 216
ZN
O
209 1ZINC ION
lig 217
NA
O
210 1SODIUM ION
lig 218
ZN
O
211 1ZINC ION
lig 219
ZN
O
212 1ZINC ION
lig 220
NA
O
213 1SODIUM ION
lig 221
ZN
O
214 1ZINC ION
lig 222
ZN
O
215 1ZINC ION
lig 223
ZN
P
201 1ZINC ION
lig 224
ZN
P
202 1ZINC ION
lig 225
NA
P
203 1SODIUM ION
lig 226
ZN
P
204 1ZINC ION
lig 227
ZN
P
205 1ZINC ION
lig 228
NA
P
206 1SODIUM ION
lig 229
ZN
P
207 1ZINC ION
lig 230
ZN
P
208 1ZINC ION
lig 231
ZN
P
209 1ZINC ION
lig 232
ZN
P
210 1ZINC ION
lig 233
ZN
P
211 1ZINC ION
lig 234
NA
P
212 1SODIUM ION
lig 235
ZN
Q
201 1ZINC ION
lig 236
NA
Q
202 1SODIUM ION
lig 237
ZN
Q
203 1ZINC ION
lig 238
ZN
Q
204 1ZINC ION
lig 239
NA
Q
205 1SODIUM ION
lig 240
ZN
Q
206 1ZINC ION
lig 241
NA
Q
207 1SODIUM ION
lig 242
ZN
Q
208 1ZINC ION
lig 243
ZN
Q
209 1ZINC ION
lig 244
ZN
Q
210 1ZINC ION
lig 245
ZN
Q
211 1ZINC ION
lig 246
ZN
Q
212 1ZINC ION
lig 247
ZN
R
201 1ZINC ION
lig 248
ZN
R
202 1ZINC ION
lig 249
ZN
R
203 1ZINC ION
lig 250
NA
R
204 1SODIUM ION
lig 251
ZN
R
205 1ZINC ION
lig 252
NA
R
206 1SODIUM ION
lig 253
ZN
R
207 1ZINC ION
lig 254
NA
R
208 1SODIUM ION
lig 255
ZN
R
209 1ZINC ION
lig 256
ZN
R
210 1ZINC ION
lig 257
ZN
R
211 1ZINC ION
lig 258
ZN
R
212 1ZINC ION
lig 259
ZN
R
213 1ZINC ION
lig 260
ZN
S
201 1ZINC ION
lig 261
ZN
S
202 1ZINC ION
lig 262
NA
S
203 1SODIUM ION
lig 263
ZN
S
204 1ZINC ION
lig 264
ZN
S
205 1ZINC ION
lig 265
NA
S
206 1SODIUM ION
lig 266
ZN
S
207 1ZINC ION
lig 267
ZN
S
208 1ZINC ION
lig 268
ZN
S
209 1ZINC ION
lig 269
ZN
S
210 1ZINC ION
lig 270
ZN
S
211 1ZINC ION
lig 271
ZN
T
201 1ZINC ION
lig 272
NA
T
202 1SODIUM ION
lig 273
ZN
T
203 1ZINC ION
lig 274
ZN
T
204 1ZINC ION
lig 275
NA
T
205 1SODIUM ION
lig 276
ZN
T
206 1ZINC ION
lig 277
NA
T
207 1SODIUM ION
lig 278
ZN
T
208 1ZINC ION
lig 279
ZN
T
209 1ZINC ION
lig 280
ZN
T
210 1ZINC ION
lig 281
ZN
T
211 1ZINC ION
lig 282
ZN
T
212 1ZINC ION
lig 283
ZN
T
213 1ZINC ION
lig 284
ZN
U
201 1ZINC ION
lig 285
ZN
U
202 1ZINC ION
lig 286
NA
U
203 1SODIUM ION
lig 287
ZN
U
204 1ZINC ION
lig 288
ZN
U
205 1ZINC ION
lig 289
NA
U
206 1SODIUM ION
lig 290
ZN
U
207 1ZINC ION
lig 291
ZN
U
208 1ZINC ION
lig 292
ZN
U
209 1ZINC ION
lig 293
ZN
U
210 1ZINC ION
lig 294
ZN
U
211 1ZINC ION
lig 295
NA
V
201 1SODIUM ION
lig 296
ZN
V
202 1ZINC ION
lig 297
ZN
V
203 1ZINC ION
lig 298
ZN
V
204 1ZINC ION
lig 299
NA
V
205 1SODIUM ION
lig 300
ZN
V
206 1ZINC ION
lig 301
NA
V
207 1SODIUM ION
lig 302
ZN
V
208 1ZINC ION
lig 303
ZN
V
209 1ZINC ION
lig 304
ZN
V
210 1ZINC ION
lig 305
ZN
V
211 1ZINC ION
lig 306
ZN
V
212 1ZINC ION
lig 307
ZN
W
201 1ZINC ION
lig 308
ZN
W
202 1ZINC ION
lig 309
NA
W
203 1SODIUM ION
lig 310
ZN
W
204 1ZINC ION
lig 311
ZN
W
205 1ZINC ION
lig 312
NA
W
206 1SODIUM ION
lig 313
ZN
W
207 1ZINC ION
lig 314
ZN
W
208 1ZINC ION
lig 315
ZN
W
209 1ZINC ION
lig 316
ZN
W
210 1ZINC ION
lig 317
ZN
W
211 1ZINC ION
lig 318
ZN
X
201 1ZINC ION
lig 319
ZN
X
202 1ZINC ION
lig 320
NA
X
203 1SODIUM ION
lig 321
ZN
X
204 1ZINC ION
lig 322
ZN
X
205 1ZINC ION
lig 323
NA
X
206 1SODIUM ION
lig 324
ZN
X
207 1ZINC ION
lig 325
ZN
X
208 1ZINC ION
lig 326
ZN
X
209 1ZINC ION
lig 327
ZN
X
210 1ZINC ION
lig 328
ZN
X
211 1ZINC ION
lig 329
ZN
X
212 1ZINC ION