Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
7XJV


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 30 ligands in PDB entry 7XJV. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
MN
A
601 1MANGANESE (II) ION
lig 2
GDD
A
602 39GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE-ALPHA-D-MANNOSE
lig 3
GOL
A
603 6GLYCEROL
lig 4
GOL
A
604 6GLYCEROL
lig 5
GOL
A
605 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
606 6GLYCEROL
lig 7
GOL
A
607 6GLYCEROL
lig 8
NA
A
608 1SODIUM ION
lig 9
MN
B
601 1MANGANESE (II) ION
lig 10
GDD
B
602 39GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE-ALPHA-D-MANNOSE
lig 11
GOL
B
603 6GLYCEROL
lig 12
GOL
B
604 6GLYCEROL
lig 13
GOL
B
605 6GLYCEROL
lig 14
GOL
B
606 6GLYCEROL
lig 15
NA
B
607 1SODIUM ION
lig 16
MN
C
601 1MANGANESE (II) ION
lig 17
GDD
C
602 39GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE-ALPHA-D-MANNOSE
lig 18
GOL
C
603 6GLYCEROL
lig 19
GOL
C
604 6GLYCEROL
lig 20
GOL
C
605 6GLYCEROL
lig 21
GOL
C
606 6GLYCEROL
lig 22
NA
C
607 1SODIUM ION
lig 23
NA
C
608 1SODIUM ION
lig 24
MN
D
601 1MANGANESE (II) ION
lig 25
GDD
D
602 39GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE-ALPHA-D-MANNOSE
lig 26
GOL
D
603 6GLYCEROL
lig 27
GOL
D
604 6GLYCEROL
lig 28
GOL
D
605 6GLYCEROL
lig 29
GOL
D
606 6GLYCEROL
lig 30
NA
D
607 1SODIUM ION