Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
7BOP


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 38 ligands in PDB entry 7BOP. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
MN
A
401 1MANGANESE (II) ION
lig 2
GDP
A
402 28GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
lig 3
NA
A
403 1SODIUM ION
lig 4
NA
A
404 1SODIUM ION
lig 5
GOL
A
405 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
406 6GLYCEROL
lig 7
GOL
A
407 6GLYCEROL
lig 8
GOL
A
408 6GLYCEROL
lig 9
MN
B
401 1MANGANESE (II) ION
lig 10
GDP
B
402 28GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
lig 11
NA
B
403 1SODIUM ION
lig 12
NA
B
404 1SODIUM ION
lig 13
GOL
B
405 6GLYCEROL
lig 14
GOL
B
406 6GLYCEROL
lig 15
GOL
B
407 6GLYCEROL
lig 16
GOL
B
408 6GLYCEROL
lig 17
MN
C
401 1MANGANESE (II) ION
lig 18
GDP
C
402 28GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
lig 19
NA
C
403 1SODIUM ION
lig 20
GOL
C
404 6GLYCEROL
lig 21
GOL
C
405 6GLYCEROL
lig 22
MN
D
401 1MANGANESE (II) ION
lig 23
GDP
D
402 28GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
lig 24
NA
D
403 1SODIUM ION
lig 25
NA
D
404 1SODIUM ION
lig 26
GOL
D
405 6GLYCEROL
lig 27
GOL
D
406 6GLYCEROL
lig 28
GOL
D
407 6GLYCEROL
lig 29
MN
E
401 1MANGANESE (II) ION
lig 30
GDP
E
402 28GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
lig 31
GOL
E
403 6GLYCEROL
lig 32
GOL
E
404 6GLYCEROL
lig 33
GOL
E
405 6GLYCEROL
lig 34
GOL
E
406 6GLYCEROL
lig 35
MN
F
401 1MANGANESE (II) ION
lig 36
GDP
F
402 28GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
lig 37
GOL
F
403 6GLYCEROL
lig 38
GOL
F
404 6GLYCEROL