Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
7KMY


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 53 ligands in PDB entry 7KMY. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
FAD
A
501 53FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE
lig 2
WPM
A
502 27 N-(1-METHYL-2-OXO-1,2-DIHYDROPYRIDIN-4-YL
lig 3
WPM
A
503 27 N-(1-METHYL-2-OXO-1,2-DIHYDROPYRIDIN-4-YL
lig 4
GOL
A
504 6GLYCEROL
lig 5
GOL
A
505 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
506 6GLYCEROL
lig 7
GOL
A
507 6GLYCEROL
lig 8
GOL
A
508 6GLYCEROL
lig 9
FAD
B
501 53FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE
lig 10
GOL
B
502 6GLYCEROL
lig 11
GOL
B
503 6GLYCEROL
lig 12
GOL
B
504 6GLYCEROL
lig 13
GOL
B
505 6GLYCEROL
lig 14
GOL
B
506 6GLYCEROL
lig 15
GOL
B
507 6GLYCEROL
lig 16
GOL
B
508 6GLYCEROL
lig 17
FAD
C
501 53FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE
lig 18
WPM
C
502 27 N-(1-METHYL-2-OXO-1,2-DIHYDROPYRIDIN-4-YL
lig 19
GOL
C
503 6GLYCEROL
lig 20
GOL
C
504 6GLYCEROL
lig 21
GOL
C
505 6GLYCEROL
lig 22
GOL
C
506 6GLYCEROL
lig 23
GOL
C
507 6GLYCEROL
lig 24
GOL
C
508 6GLYCEROL
lig 25
GOL
C
509 6GLYCEROL
lig 26
FAD
D
501 53FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE
lig 27
WPM
D
502 27 N-(1-METHYL-2-OXO-1,2-DIHYDROPYRIDIN-4-YL
lig 28
GOL
D
503 6GLYCEROL
lig 29
GOL
D
504 6GLYCEROL
lig 30
FAD
I
501 53FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE
lig 31
GOL
I
502 6GLYCEROL
lig 32
GOL
I
503 6GLYCEROL
lig 33
GOL
I
504 6GLYCEROL
lig 34
GOL
I
505 6GLYCEROL
lig 35
FAD
J
501 53FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE
lig 36
WPM
J
502 27 N-(1-METHYL-2-OXO-1,2-DIHYDROPYRIDIN-4-YL
lig 37
WPM
J
503 27 N-(1-METHYL-2-OXO-1,2-DIHYDROPYRIDIN-4-YL
lig 38
GOL
J
504 6GLYCEROL
lig 39
GOL
J
505 6GLYCEROL
lig 40
GOL
J
506 6GLYCEROL
lig 41
GOL
J
507 6GLYCEROL
lig 42
GOL
J
508 6GLYCEROL
lig 43
GOL
J
509 6GLYCEROL
lig 44
FAD
M
501 53FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE
lig 45
WPM
M
502 27 N-(1-METHYL-2-OXO-1,2-DIHYDROPYRIDIN-4-YL
lig 46
WPM
M
503 27 N-(1-METHYL-2-OXO-1,2-DIHYDROPYRIDIN-4-YL
lig 47
GOL
M
504 6GLYCEROL
lig 48
GOL
M
505 6GLYCEROL
lig 49
GOL
M
506 6GLYCEROL
lig 50
GOL
M
507 6GLYCEROL
lig 51
FAD
N
501 53FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE
lig 52
GOL
N
502 6GLYCEROL
lig 53
GOL
N
503 6GLYCEROL