Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
7KQ8


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 56 ligands in PDB entry 7KQ8. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
GSH
A
301 20GLUTATHIONE
lig 2
EDO
A
302 41,2-ETHANEDIOL
lig 3
EDO
A
303 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
304 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
305 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
306 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
307 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
308 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
309 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
310 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
311 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
A
312 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
A
313 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
A
314 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
A
315 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
A
316 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
FE2
A
317 1FE (II) ION
lig 18
GSH
B
301 20GLUTATHIONE
lig 19
GOL
B
302 6GLYCEROL
lig 20
EDO
B
303 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
B
304 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
EDO
B
305 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
B
306 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
B
307 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
B
308 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
B
309 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
EDO
B
310 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
B
311 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
PEG
B
312 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 30
EDO
B
313 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
EDO
B
314 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
B
315 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
FE2
B
316 1FE (II) ION
lig 34
GSH
C
301 20GLUTATHIONE
lig 35
EDO
C
302 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
C
303 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
C
304 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
PEG
C
305 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 39
PEG
C
306 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 40
GOL
C
307 6GLYCEROL
lig 41
EDO
C
308 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
EDO
C
309 41,2-ETHANEDIOL
lig 43
EDO
C
310 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
FE2
C
311 1FE (II) ION
lig 45
GSH
D
301 20GLUTATHIONE
lig 46
GOL
D
302 6GLYCEROL
lig 47
EDO
D
303 41,2-ETHANEDIOL
lig 48
EDO
D
304 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
EDO
D
305 41,2-ETHANEDIOL
lig 50
EDO
D
306 41,2-ETHANEDIOL
lig 51
EDO
D
307 41,2-ETHANEDIOL
lig 52
EDO
D
308 41,2-ETHANEDIOL
lig 53
EDO
D
309 41,2-ETHANEDIOL
lig 54
EDO
D
310 41,2-ETHANEDIOL
lig 55
EDO
D
311 41,2-ETHANEDIOL
lig 56
FE2
D
312 1FE (II) ION