Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
7M8R


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 51 ligands in PDB entry 7M8R. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
FTR
D
76 15FLUOROTRYPTOPHANE
lig 2
FTR
D
77 15FLUOROTRYPTOPHANE
lig 3
FTR
H
76 15FLUOROTRYPTOPHANE
lig 4
FTR
H
77 15FLUOROTRYPTOPHANE
lig 5
FE
A
601 1FE (III) ION
lig 6
FE
A
602 1FE (III) ION
lig 7
EDO
A
603 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
604 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
605 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
606 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
BEZ
A
607 9BENZOIC ACID
lig 12
EDO
A
608 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
A
609 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
A
610 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
A
611 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
A
612 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
A
613 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
B
401 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
B
402 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
B
403 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
B
404 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
EDO
B
405 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
C
201 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
C
202 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
D
201 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
W6X
D
202 71,1,1-TRIS(FLUORANYL)PROPAN-2-ONE
lig 27
CL
D
203 1CHLORIDE ION
lig 28
FE
E
601 1FE (III) ION
lig 29
FE
E
602 1FE (III) ION
lig 30
EDO
E
603 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
EDO
E
604 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
E
605 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
BEZ
E
606 9BENZOIC ACID
lig 34
EDO
E
607 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
E
608 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
E
609 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
E
610 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
F
401 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
F
402 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
EDO
F
403 41,2-ETHANEDIOL
lig 41
EDO
F
404 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
EDO
F
405 41,2-ETHANEDIOL
lig 43
EDO
F
406 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
EDO
F
407 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
EDO
F
408 41,2-ETHANEDIOL
lig 46
EDO
F
409 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
EDO
G
201 41,2-ETHANEDIOL
lig 48
EDO
G
202 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
EDO
G
203 41,2-ETHANEDIOL
lig 50
EDO
H
201 41,2-ETHANEDIOL
lig 51
W6X
H
202 71,1,1-TRIS(FLUORANYL)PROPAN-2-ONE