Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
7NGE


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 48 ligands in PDB entry 7NGE. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
TRP
A
501 15TRYPTOPHAN
lig 2
NFK
A
502 17N'-FORMYLKYNURENINE
lig 3
GOL
A
503 6GLYCEROL
lig 4
GOL
A
504 6GLYCEROL
lig 5
GOL
A
505 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
506 6GLYCEROL
lig 7
GOL
A
507 6GLYCEROL
lig 8
GOL
A
508 6GLYCEROL
lig 9
GOL
A
509 6GLYCEROL
lig 10
GOL
A
510 6GLYCEROL
lig 11
HEM
A
511 43PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
lig 12
NA
A
512 1SODIUM ION
lig 13
TRP
B
501 15TRYPTOPHAN
lig 14
TRP
B
502 15TRYPTOPHAN
lig 15
GOL
B
503 6GLYCEROL
lig 16
GOL
B
504 6GLYCEROL
lig 17
GOL
B
505 6GLYCEROL
lig 18
GOL
B
506 6GLYCEROL
lig 19
GOL
B
507 6GLYCEROL
lig 20
GOL
B
508 6GLYCEROL
lig 21
GOL
B
509 6GLYCEROL
lig 22
GOL
B
510 6GLYCEROL
lig 23
HEM
B
511 43PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
lig 24
PO4
B
512 5PHOSPHATE ION
lig 25
PO4
B
513 5PHOSPHATE ION
lig 26
TRP
C
501 15TRYPTOPHAN
lig 27
GOL
C
502 6GLYCEROL
lig 28
GOL
C
503 6GLYCEROL
lig 29
GOL
C
504 6GLYCEROL
lig 30
GOL
C
505 6GLYCEROL
lig 31
GOL
C
506 6GLYCEROL
lig 32
GOL
C
507 6GLYCEROL
lig 33
GOL
C
508 6GLYCEROL
lig 34
GOL
C
509 6GLYCEROL
lig 35
GOL
C
510 6GLYCEROL
lig 36
GOL
C
511 6GLYCEROL
lig 37
GOL
C
512 6GLYCEROL
lig 38
GOL
C
513 6GLYCEROL
lig 39
HEM
C
514 43PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
lig 40
CL
C
515 1CHLORIDE ION
lig 41
PO4
C
516 5PHOSPHATE ION
lig 42
NFK
D
501 17N'-FORMYLKYNURENINE
lig 43
GOL
D
502 6GLYCEROL
lig 44
GOL
D
503 6GLYCEROL
lig 45
GOL
D
504 6GLYCEROL
lig 46
GOL
D
505 6GLYCEROL
lig 47
GOL
D
506 6GLYCEROL
lig 48
HEM
D
507 43PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE