Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
7QIR


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 43 ligands in PDB entry 7QIR. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
7OZ
D
15 7(S)-2-AMINO-4-FLUOROBUTANOIC ACID
lig 2
7OZ
H
15 7(S)-2-AMINO-4-FLUOROBUTANOIC ACID
lig 3
GOL
B
301 6GLYCEROL
lig 4
GOL
B
302 6GLYCEROL
lig 5
GOL
B
303 6GLYCEROL
lig 6
GOL
B
304 6GLYCEROL
lig 7
GOL
B
305 6GLYCEROL
lig 8
SO4
B
306 5SULFATE ION
lig 9
SO4
B
307 5SULFATE ION
lig 10
GOL
C
301 6GLYCEROL
lig 11
GOL
C
302 6GLYCEROL
lig 12
GOL
C
303 6GLYCEROL
lig 13
GOL
C
304 6GLYCEROL
lig 14
GOL
C
305 6GLYCEROL
lig 15
GOL
C
306 6GLYCEROL
lig 16
GOL
C
307 6GLYCEROL
lig 17
GOL
C
308 6GLYCEROL
lig 18
GOL
C
309 6GLYCEROL
lig 19
GOL
C
310 6GLYCEROL
lig 20
GOL
C
311 6GLYCEROL
lig 21
SO4
C
312 5SULFATE ION
lig 22
SO4
C
313 5SULFATE ION
lig 23
GOL
D
101 6GLYCEROL
lig 24
GOL
D
102 6GLYCEROL
lig 25
SO4
D
103 5SULFATE ION
lig 26
SO4
D
104 5SULFATE ION
lig 27
SO4
D
105 5SULFATE ION
lig 28
SO4
D
106 5SULFATE ION
lig 29
SO4
D
108 5SULFATE ION
lig 30
GOL
F
201 6GLYCEROL
lig 31
GOL
F
202 6GLYCEROL
lig 32
GOL
F
203 6GLYCEROL
lig 33
GOL
F
204 6GLYCEROL
lig 34
GOL
F
205 6GLYCEROL
lig 35
GOL
F
206 6GLYCEROL
lig 36
SO4
F
207 5SULFATE ION
lig 37
SO4
F
208 5SULFATE ION
lig 38
GOL
G
301 6GLYCEROL
lig 39
GOL
G
302 6GLYCEROL
lig 40
GOL
G
303 6GLYCEROL
lig 41
SO4
G
304 5SULFATE ION
lig 42
GOL
H
101 6GLYCEROL
lig 43
SO4
H
102 5SULFATE ION