Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
8BAI


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 31 ligands in PDB entry 8BAI. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
GOL
A
401 6GLYCEROL
lig 2
GOL
A
402 6GLYCEROL
lig 3
GOL
A
403 6GLYCEROL
lig 4
GOL
A
404 6GLYCEROL
lig 5
GOL
A
405 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
406 6GLYCEROL
lig 7
GOL
A
407 6GLYCEROL
lig 8
CNC
A
408 93CYANOCOBALAMIN
lig 9
GOL
B
401 6GLYCEROL
lig 10
GOL
B
402 6GLYCEROL
lig 11
GOL
B
403 6GLYCEROL
lig 12
GOL
B
404 6GLYCEROL
lig 13
GOL
B
405 6GLYCEROL
lig 14
GOL
B
406 6GLYCEROL
lig 15
SO4
B
407 5SULFATE ION
lig 16
CNC
B
408 93CYANOCOBALAMIN
lig 17
PEG
B
409 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 18
GOL
C
401 6GLYCEROL
lig 19
GOL
C
402 6GLYCEROL
lig 20
GOL
C
403 6GLYCEROL
lig 21
PEG
C
404 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 22
SO4
C
405 5SULFATE ION
lig 23
CNC
C
406 93CYANOCOBALAMIN
lig 24
GOL
D
401 6GLYCEROL
lig 25
GOL
D
402 6GLYCEROL
lig 26
GOL
D
403 6GLYCEROL
lig 27
GOL
D
404 6GLYCEROL
lig 28
GOL
D
405 6GLYCEROL
lig 29
CNC
D
406 93CYANOCOBALAMIN
lig 30
NA
D
407 1SODIUM ION
lig 31
NA
D
408 1SODIUM ION