Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
8HHV


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 28 ligands in PDB entry 8HHV. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
NA
A
501 1SODIUM ION
lig 2
NA
A
502 1SODIUM ION
lig 3
CA
A
503 1CALCIUM ION
lig 4
GOL
A
504 6GLYCEROL
lig 5
GOL
A
505 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
506 6GLYCEROL
lig 7
GOL
A
507 6GLYCEROL
lig 8
NA
B
501 1SODIUM ION
lig 9
NA
B
502 1SODIUM ION
lig 10
CA
B
503 1CALCIUM ION
lig 11
GOL
B
504 6GLYCEROL
lig 12
GOL
B
505 6GLYCEROL
lig 13
GOL
B
506 6GLYCEROL
lig 14
NA
C
501 1SODIUM ION
lig 15
NA
C
502 1SODIUM ION
lig 16
CA
C
503 1CALCIUM ION
lig 17
GOL
C
504 6GLYCEROL
lig 18
GOL
C
505 6GLYCEROL
lig 19
GOL
C
506 6GLYCEROL
lig 20
NA
D
501 1SODIUM ION
lig 21
NA
D
502 1SODIUM ION
lig 22
CA
D
503 1CALCIUM ION
lig 23
GOL
D
504 6GLYCEROL
lig 24
GOL
D
505 6GLYCEROL
lig 25
GOL
D
506 6GLYCEROL
lig 26
GOL
D
507 6GLYCEROL
lig 27
GOL
D
508 6GLYCEROL
lig 28
GOL
D
509 6GLYCEROL