Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
8ASA


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 104 ligands in PDB entry 8ASA. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
GOL
A
301 6GLYCEROL
lig 2
GOL
A
302 6GLYCEROL
lig 3
GOL
A
303 6GLYCEROL
lig 4
GOL
A
304 6GLYCEROL
lig 5
EDO
A
305 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
306 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
307 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
308 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
MG
A
309 1MAGNESIUM ION
lig 10
MG
A
310 1MAGNESIUM ION
lig 11
MG
A
311 1MAGNESIUM ION
lig 12
MG
A
312 1MAGNESIUM ION
lig 13
MG
A
313 1MAGNESIUM ION
lig 14
MG
A
314 1MAGNESIUM ION
lig 15
CA
A
315 1CALCIUM ION
lig 16
CA
A
316 1CALCIUM ION
lig 17
BCN
A
317 11BICINE
lig 18
GOL
B
301 6GLYCEROL
lig 19
GOL
B
302 6GLYCEROL
lig 20
GOL
B
303 6GLYCEROL
lig 21
EDO
B
304 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
EDO
B
305 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
B
306 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
MG
B
307 1MAGNESIUM ION
lig 25
MG
B
308 1MAGNESIUM ION
lig 26
MG
B
309 1MAGNESIUM ION
lig 27
CA
B
310 1CALCIUM ION
lig 28
CA
B
311 1CALCIUM ION
lig 29
CA
B
312 1CALCIUM ION
lig 30
BCN
B
313 11BICINE
lig 31
GOL
C
301 6GLYCEROL
lig 32
GOL
C
302 6GLYCEROL
lig 33
GOL
C
303 6GLYCEROL
lig 34
EDO
C
304 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
C
305 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
C
306 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
C
307 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
CA
C
308 1CALCIUM ION
lig 39
CA
C
309 1CALCIUM ION
lig 40
CA
C
310 1CALCIUM ION
lig 41
BCN
C
311 11BICINE
lig 42
GOL
D
301 6GLYCEROL
lig 43
EDO
D
302 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
EDO
D
303 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
EDO
D
304 41,2-ETHANEDIOL
lig 46
EDO
D
305 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
EDO
D
306 41,2-ETHANEDIOL
lig 48
EDO
D
307 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
MG
D
308 1MAGNESIUM ION
lig 50
MG
D
309 1MAGNESIUM ION
lig 51
MG
D
310 1MAGNESIUM ION
lig 52
MG
D
311 1MAGNESIUM ION
lig 53
MG
D
312 1MAGNESIUM ION
lig 54
CA
D
313 1CALCIUM ION
lig 55
CA
D
314 1CALCIUM ION
lig 56
CA
D
315 1CALCIUM ION
lig 57
CA
D
316 1CALCIUM ION
lig 58
CA
D
317 1CALCIUM ION
lig 59
CA
D
318 1CALCIUM ION
lig 60
CA
D
319 1CALCIUM ION
lig 61
BCN
D
320 11BICINE
lig 62
BCN
D
321 11BICINE
lig 63
EDO
E
301 41,2-ETHANEDIOL
lig 64
EDO
E
302 41,2-ETHANEDIOL
lig 65
EDO
E
303 41,2-ETHANEDIOL
lig 66
MG
E
304 1MAGNESIUM ION
lig 67
MG
E
305 1MAGNESIUM ION
lig 68
MG
E
306 1MAGNESIUM ION
lig 69
CA
E
307 1CALCIUM ION
lig 70
CA
E
308 1CALCIUM ION
lig 71
CA
E
309 1CALCIUM ION
lig 72
CA
E
310 1CALCIUM ION
lig 73
BCN
E
311 11BICINE
lig 74
GOL
F
301 6GLYCEROL
lig 75
EDO
F
302 41,2-ETHANEDIOL
lig 76
EDO
F
303 41,2-ETHANEDIOL
lig 77
EDO
F
304 41,2-ETHANEDIOL
lig 78
EDO
F
305 41,2-ETHANEDIOL
lig 79
MG
F
306 1MAGNESIUM ION
lig 80
MG
F
307 1MAGNESIUM ION
lig 81
MG
F
308 1MAGNESIUM ION
lig 82
CA
F
309 1CALCIUM ION
lig 83
CA
F
310 1CALCIUM ION
lig 84
BCN
F
311 11BICINE
lig 85
GOL
G
301 6GLYCEROL
lig 86
EDO
G
302 41,2-ETHANEDIOL
lig 87
EDO
G
303 41,2-ETHANEDIOL
lig 88
EDO
G
304 41,2-ETHANEDIOL
lig 89
EDO
G
305 41,2-ETHANEDIOL
lig 90
MG
G
306 1MAGNESIUM ION
lig 91
MG
G
307 1MAGNESIUM ION
lig 92
MG
G
308 1MAGNESIUM ION
lig 93
MG
G
309 1MAGNESIUM ION
lig 94
MG
G
310 1MAGNESIUM ION
lig 95
CA
G
311 1CALCIUM ION
lig 96
BCN
G
312 11BICINE
lig 97
GOL
H
301 6GLYCEROL
lig 98
EDO
H
302 41,2-ETHANEDIOL
lig 99
EDO
H
303 41,2-ETHANEDIOL
lig 100
CA
H
304 1CALCIUM ION
lig 101
CA
H
305 1CALCIUM ION
lig 102
CA
H
306 1CALCIUM ION
lig 103
CA
H
307 1CALCIUM ION
lig 104
BCN
H
308 11BICINE