Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
8BDW


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 36 ligands in PDB entry 8BDW. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
GOL
A
101 6GLYCEROL
lig 2
GOL
A
102 6GLYCEROL
lig 3
GOL
B
101 6GLYCEROL
lig 4
GOL
C
101 6GLYCEROL
lig 5
GOL
D
101 6GLYCEROL
lig 6
GOL
D
102 6GLYCEROL
lig 7
GOL
D
103 6GLYCEROL
lig 8
GOL
D
104 6GLYCEROL
lig 9
GOL
E
101 6GLYCEROL
lig 10
GOL
E
102 6GLYCEROL
lig 11
SO4
E
103 5SULFATE ION
lig 12
GOL
F
101 6GLYCEROL
lig 13
GOL
F
102 6GLYCEROL
lig 14
GOL
G
101 6GLYCEROL
lig 15
GOL
G
102 6GLYCEROL
lig 16
GOL
G
103 6GLYCEROL
lig 17
GOL
G
104 6GLYCEROL
lig 18
GOL
G
105 6GLYCEROL
lig 19
SO4
G
106 5SULFATE ION
lig 20
GOL
H
101 6GLYCEROL
lig 21
GOL
H
102 6GLYCEROL
lig 22
GOL
I
101 6GLYCEROL
lig 23
GOL
I
102 6GLYCEROL
lig 24
GOL
I
103 6GLYCEROL
lig 25
SO4
I
104 5SULFATE ION
lig 26
GOL
I
105 6GLYCEROL
lig 27
GOL
J
101 6GLYCEROL
lig 28
GOL
J
102 6GLYCEROL
lig 29
GOL
J
103 6GLYCEROL
lig 30
SO4
J
104 5SULFATE ION
lig 31
GOL
K
101 6GLYCEROL
lig 32
GOL
K
102 6GLYCEROL
lig 33
GOL
L
101 6GLYCEROL
lig 34
TRS
L
102 82-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL
lig 35
GOL
L
103 6GLYCEROL
lig 36
GOL
L
104 6GLYCEROL