Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
8BSD


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 37 ligands in PDB entry 8BSD. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
EDO
A
7201 41,2-ETHANEDIOL
lig 2
EDO
A
7202 41,2-ETHANEDIOL
lig 3
MES
A
7203 122-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID
lig 4
EDO
A
7204 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
7205 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
7206 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
7207 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
7208 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
7209 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
7210 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
7211 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
A
7212 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
A
7213 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
A
7214 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
A
7215 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
A
7216 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
A
7217 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
A
7218 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
A
7219 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
TBN
A
7220 19 HYDROXYMETHYL-TETRAHYDRO-FURAN-3,4-DIOL
lig 21
EDO
A
7221 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
EDO
A
7222 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
A
7223 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
A
7224 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
A
7225 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
A
7226 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
EDO
A
7227 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
A
7228 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
CL
A
7229 1CHLORIDE ION
lig 30
CL
A
7230 1CHLORIDE ION
lig 31
EDO
B
4401 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
ZN
B
4402 1ZINC ION
lig 33
ZN
B
4403 1ZINC ION
lig 34
EDO
B
4404 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
B
4405 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
B
4406 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
B
4407 41,2-ETHANEDIOL