Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
8GT0


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 176 ligands in PDB entry 8GT0. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
GOL
A
301 6GLYCEROL
lig 2
GOL
A
302 6GLYCEROL
lig 3
GOL
A
303 6GLYCEROL
lig 4
GOL
A
304 6GLYCEROL
lig 5
GOL
A
305 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
306 6GLYCEROL
lig 7
GOL
A
307 6GLYCEROL
lig 8
GOL
A
308 6GLYCEROL
lig 9
GOL
A
309 6GLYCEROL
lig 10
GOL
A
310 6GLYCEROL
lig 11
GOL
A
311 6GLYCEROL
lig 12
GOL
A
312 6GLYCEROL
lig 13
GOL
A
313 6GLYCEROL
lig 14
GOL
A
314 6GLYCEROL
lig 15
NA
A
315 1SODIUM ION
lig 16
NA
A
316 1SODIUM ION
lig 17
NA
A
317 1SODIUM ION
lig 18
PEG
A
318 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 19
PEG
A
319 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 20
PEG
A
320 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 21
PEG
A
321 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 22
PE8
A
322 253,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-D
lig 23
PE8
A
323 253,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-D
lig 24
PE8
A
324 253,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-D
lig 25
EDO
A
325 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
A
326 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
EDO
A
327 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
PG4
A
328 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 29
PG4
A
329 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 30
PG4
A
330 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 31
PG4
A
331 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 32
PG4
A
332 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 33
PG4
A
333 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 34
PG4
A
334 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 35
PEG
A
335 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 36
EDO
A
336 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
PG4
A
337 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 38
PG4
A
338 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 39
NA
A
339 1SODIUM ION
lig 40
GOL
A
340 6GLYCEROL
lig 41
PEG
A
341 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 42
PEG
A
342 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 43
EDO
A
343 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
PG4
A
344 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 45
GOL
A
345 6GLYCEROL
lig 46
GOL
A
346 6GLYCEROL
lig 47
GOL
B
101 6GLYCEROL
lig 48
GOL
B
102 6GLYCEROL
lig 49
EDO
B
103 41,2-ETHANEDIOL
lig 50
PG4
B
104 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 51
PE8
B
105 253,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-D
lig 52
GOL
B
106 6GLYCEROL
lig 53
GOL
B
107 6GLYCEROL
lig 54
GOL
B
108 6GLYCEROL
lig 55
GOL
B
109 6GLYCEROL
lig 56
GOL
B
110 6GLYCEROL
lig 57
GOL
B
111 6GLYCEROL
lig 58
GOL
B
112 6GLYCEROL
lig 59
GOL
B
113 6GLYCEROL
lig 60
GOL
B
114 6GLYCEROL
lig 61
GOL
B
115 6GLYCEROL
lig 62
GOL
B
116 6GLYCEROL
lig 63
NA
B
117 1SODIUM ION
lig 64
NA
B
118 1SODIUM ION
lig 65
SO4
B
119 5SULFATE ION
lig 66
PEG
B
120 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 67
PE8
B
121 253,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-D
lig 68
PE8
B
122 253,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-D
lig 69
PE8
B
123 253,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-D
lig 70
EDO
B
124 41,2-ETHANEDIOL
lig 71
PG4
B
125 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 72
PG4
B
126 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 73
PG4
B
127 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 74
PG4
B
128 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 75
PG4
B
129 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 76
GOL
B
130 6GLYCEROL
lig 77
PE8
B
131 253,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-D
lig 78
GOL
B
132 6GLYCEROL
lig 79
NA
B
133 1SODIUM ION
lig 80
GOL
B
134 6GLYCEROL
lig 81
GOL
B
135 6GLYCEROL
lig 82
GOL
B
136 6GLYCEROL
lig 83
GOL
B
137 6GLYCEROL
lig 84
GOL
B
138 6GLYCEROL
lig 85
PEG
B
139 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 86
GOL
B
140 6GLYCEROL
lig 87
NA
B
142 1SODIUM ION
lig 88
NA
B
143 1SODIUM ION
lig 89
NA
B
144 1SODIUM ION
lig 90
GOL
C
301 6GLYCEROL
lig 91
GOL
C
302 6GLYCEROL
lig 92
GOL
C
303 6GLYCEROL
lig 93
GOL
C
304 6GLYCEROL
lig 94
GOL
C
305 6GLYCEROL
lig 95
GOL
C
306 6GLYCEROL
lig 96
GOL
C
307 6GLYCEROL
lig 97
GOL
C
308 6GLYCEROL
lig 98
GOL
C
309 6GLYCEROL
lig 99
GOL
C
310 6GLYCEROL
lig 100
GOL
C
311 6GLYCEROL
lig 101
NA
C
312 1SODIUM ION
lig 102
NA
C
313 1SODIUM ION
lig 103
NA
C
314 1SODIUM ION
lig 104
PEG
C
315 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 105
PEG
C
316 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 106
PEG
C
317 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 107
PEG
C
318 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 108
PEG
C
319 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 109
PEG
C
320 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 110
PE8
C
321 253,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-D
lig 111
PE8
C
322 253,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-D
lig 112
EDO
C
323 41,2-ETHANEDIOL
lig 113
PG4
C
324 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 114
PG4
C
325 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 115
PG4
C
326 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 116
PG4
C
327 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 117
EDO
C
328 41,2-ETHANEDIOL
lig 118
EDO
C
329 41,2-ETHANEDIOL
lig 119
PEG
C
330 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 120
GOL
C
331 6GLYCEROL
lig 121
PG4
C
332 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 122
NA
C
333 1SODIUM ION
lig 123
EDO
C
334 41,2-ETHANEDIOL
lig 124
NA
C
335 1SODIUM ION
lig 125
SO4
C
336 5SULFATE ION
lig 126
PG4
C
337 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 127
GOL
C
338 6GLYCEROL
lig 128
PEG
C
339 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 129
PEG
C
340 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 130
GOL
C
341 6GLYCEROL
lig 131
GOL
C
342 6GLYCEROL
lig 132
PG4
D
101 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 133
NA
D
102 1SODIUM ION
lig 134
GOL
D
103 6GLYCEROL
lig 135
NA
D
104 1SODIUM ION
lig 136
PG4
D
105 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 137
GOL
D
106 6GLYCEROL
lig 138
GOL
D
107 6GLYCEROL
lig 139
GOL
D
108 6GLYCEROL
lig 140
GOL
D
109 6GLYCEROL
lig 141
GOL
D
110 6GLYCEROL
lig 142
NA
D
111 1SODIUM ION
lig 143
SO4
D
112 5SULFATE ION
lig 144
SO4
D
113 5SULFATE ION
lig 145
SO4
D
114 5SULFATE ION
lig 146
PEG
D
115 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 147
PG4
D
116 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 148
PG4
D
117 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 149
PG4
D
118 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 150
PG4
D
119 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 151
CL
D
120 1CHLORIDE ION
lig 152
PG4
D
121 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 153
GOL
D
122 6GLYCEROL
lig 154
PEG
D
123 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 155
GOL
D
124 6GLYCEROL
lig 156
NA
D
125 1SODIUM ION
lig 157
SO4
D
126 5SULFATE ION
lig 158
PG4
D
127 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 159
NA
D
128 1SODIUM ION
lig 160
NA
D
129 1SODIUM ION
lig 161
NA
D
130 1SODIUM ION
lig 162
NA
D
131 1SODIUM ION
lig 163
PG4
E
101 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 164
GOL
E
102 6GLYCEROL
lig 165
GOL
E
103 6GLYCEROL
lig 166
GOL
E
104 6GLYCEROL
lig 167
NA
E
105 1SODIUM ION
lig 168
NA
E
106 1SODIUM ION
lig 169
SO4
E
107 5SULFATE ION
lig 170
PEG
E
108 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 171
PEG
E
109 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 172
PEG
E
110 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 173
PEG
E
111 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 174
PE8
E
112 253,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-D
lig 175
PE8
E
113 253,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-D
lig 176
PE8
E
114 253,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-D