Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
8IFU


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 57 ligands in PDB entry 8IFU. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
RET
A
301 20RETINAL
lig 2
NA
A
302 1SODIUM ION
lig 3
NA
A
303 1SODIUM ION
lig 4
NA
A
304 1SODIUM ION
lig 5
NA
A
305 1SODIUM ION
lig 6
NA
A
306 1SODIUM ION
lig 7
NA
A
307 1SODIUM ION
lig 8
NA
A
308 1SODIUM ION
lig 9
NA
A
309 1SODIUM ION
lig 10
NA
A
310 1SODIUM ION
lig 11
NA
A
311 1SODIUM ION
lig 12
NA
A
312 1SODIUM ION
lig 13
NA
A
313 1SODIUM ION
lig 14
NA
A
314 1SODIUM ION
lig 15
NA
A
315 1SODIUM ION
lig 16
NA
A
316 1SODIUM ION
lig 17
NA
A
317 1SODIUM ION
lig 18
L9Q
A
318 51 [(OCTADECANOYLOXY)METHYL]ETHYL (9Z)-OCTAD
lig 19
L9Q
A
319 51 [(OCTADECANOYLOXY)METHYL]ETHYL (9Z)-OCTAD
lig 20
L9Q
B
301 51 [(OCTADECANOYLOXY)METHYL]ETHYL (9Z)-OCTAD
lig 21
RET
B
302 20RETINAL
lig 22
NA
B
303 1SODIUM ION
lig 23
NA
B
304 1SODIUM ION
lig 24
NA
B
305 1SODIUM ION
lig 25
NA
B
306 1SODIUM ION
lig 26
NA
B
307 1SODIUM ION
lig 27
NA
B
308 1SODIUM ION
lig 28
NA
B
309 1SODIUM ION
lig 29
NA
B
310 1SODIUM ION
lig 30
NA
B
311 1SODIUM ION
lig 31
NA
B
312 1SODIUM ION
lig 32
NA
B
313 1SODIUM ION
lig 33
NA
B
314 1SODIUM ION
lig 34
NA
B
315 1SODIUM ION
lig 35
NA
B
316 1SODIUM ION
lig 36
NA
B
317 1SODIUM ION
lig 37
NA
B
318 1SODIUM ION
lig 38
L9Q
B
319 51 [(OCTADECANOYLOXY)METHYL]ETHYL (9Z)-OCTAD
lig 39
L9Q
C
301 51 [(OCTADECANOYLOXY)METHYL]ETHYL (9Z)-OCTAD
lig 40
L9Q
C
302 51 [(OCTADECANOYLOXY)METHYL]ETHYL (9Z)-OCTAD
lig 41
RET
C
303 20RETINAL
lig 42
NA
C
304 1SODIUM ION
lig 43
NA
C
305 1SODIUM ION
lig 44
NA
C
306 1SODIUM ION
lig 45
NA
C
307 1SODIUM ION
lig 46
NA
C
308 1SODIUM ION
lig 47
NA
C
309 1SODIUM ION
lig 48
NA
C
310 1SODIUM ION
lig 49
NA
C
311 1SODIUM ION
lig 50
NA
C
312 1SODIUM ION
lig 51
NA
C
313 1SODIUM ION
lig 52
NA
C
314 1SODIUM ION
lig 53
NA
C
315 1SODIUM ION
lig 54
NA
C
316 1SODIUM ION
lig 55
NA
C
317 1SODIUM ION
lig 56
NA
C
318 1SODIUM ION
lig 57
NA
C
319 1SODIUM ION