Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
8JT1


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 112 ligands in PDB entry 8JT1. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
HYP
C
3 84-HYDROXYPROLINE
lig 2
HYP
C
6 94-HYDROXYPROLINE
lig 3
HYP
E
3 84-HYDROXYPROLINE
lig 4
HYP
E
6 94-HYDROXYPROLINE
lig 5
HYP
F
6 84-HYDROXYPROLINE
lig 6
HYP
G
3 84-HYDROXYPROLINE
lig 7
HYP
G
6 94-HYDROXYPROLINE
lig 8
HYP
I
3 84-HYDROXYPROLINE
lig 9
HYP
I
6 94-HYDROXYPROLINE
lig 10
HYP
J
6 84-HYDROXYPROLINE
lig 11
ZN
A
701 1ZINC ION
lig 12
CA
A
702 1CALCIUM ION
lig 13
CA
A
703 1CALCIUM ION
lig 14
CA
A
704 1CALCIUM ION
lig 15
CA
A
705 1CALCIUM ION
lig 16
EDO
A
706 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
A
707 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
A
708 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
A
709 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
A
710 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
A
711 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
EDO
A
712 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
A
713 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
A
714 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
A
715 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
A
716 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
EDO
A
717 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
A
718 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
A
719 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
EDO
A
720 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
EDO
A
721 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
A
722 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
EDO
A
723 41,2-ETHANEDIOL
lig 34
EDO
A
724 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
A
725 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
A
726 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
A
727 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
A
728 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
A
729 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
EDO
A
730 41,2-ETHANEDIOL
lig 41
EDO
A
731 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
EDO
A
732 41,2-ETHANEDIOL
lig 43
EDO
A
733 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
EDO
A
734 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
EDO
A
735 41,2-ETHANEDIOL
lig 46
EDO
A
736 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
EDO
A
737 41,2-ETHANEDIOL
lig 48
EDO
A
738 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
EDO
A
739 41,2-ETHANEDIOL
lig 50
EDO
A
740 41,2-ETHANEDIOL
lig 51
EDO
A
741 41,2-ETHANEDIOL
lig 52
EDO
A
742 41,2-ETHANEDIOL
lig 53
EDO
A
743 41,2-ETHANEDIOL
lig 54
EDO
A
744 41,2-ETHANEDIOL
lig 55
EDO
A
745 41,2-ETHANEDIOL
lig 56
EDO
A
746 41,2-ETHANEDIOL
lig 57
EDO
A
747 41,2-ETHANEDIOL
lig 58
EDO
A
748 41,2-ETHANEDIOL
lig 59
EDO
A
749 41,2-ETHANEDIOL
lig 60
PGE
A
750 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 61
ZN
B
701 1ZINC ION
lig 62
CA
B
702 1CALCIUM ION
lig 63
CA
B
703 1CALCIUM ION
lig 64
CA
B
704 1CALCIUM ION
lig 65
CA
B
705 1CALCIUM ION
lig 66
EDO
B
706 41,2-ETHANEDIOL
lig 67
EDO
B
707 41,2-ETHANEDIOL
lig 68
EDO
B
708 41,2-ETHANEDIOL
lig 69
EDO
B
709 41,2-ETHANEDIOL
lig 70
EDO
B
710 41,2-ETHANEDIOL
lig 71
EDO
B
711 41,2-ETHANEDIOL
lig 72
EDO
B
712 41,2-ETHANEDIOL
lig 73
EDO
B
713 41,2-ETHANEDIOL
lig 74
EDO
B
714 41,2-ETHANEDIOL
lig 75
EDO
B
715 41,2-ETHANEDIOL
lig 76
EDO
B
716 41,2-ETHANEDIOL
lig 77
EDO
B
717 41,2-ETHANEDIOL
lig 78
EDO
B
718 41,2-ETHANEDIOL
lig 79
EDO
B
719 41,2-ETHANEDIOL
lig 80
EDO
B
720 41,2-ETHANEDIOL
lig 81
EDO
B
721 41,2-ETHANEDIOL
lig 82
EDO
B
722 41,2-ETHANEDIOL
lig 83
EDO
B
723 41,2-ETHANEDIOL
lig 84
EDO
B
724 41,2-ETHANEDIOL
lig 85
EDO
B
725 41,2-ETHANEDIOL
lig 86
EDO
B
726 41,2-ETHANEDIOL
lig 87
EDO
B
727 41,2-ETHANEDIOL
lig 88
EDO
B
728 41,2-ETHANEDIOL
lig 89
EDO
B
729 41,2-ETHANEDIOL
lig 90
EDO
B
730 41,2-ETHANEDIOL
lig 91
EDO
B
731 41,2-ETHANEDIOL
lig 92
EDO
B
732 41,2-ETHANEDIOL
lig 93
EDO
B
733 41,2-ETHANEDIOL
lig 94
EDO
B
734 41,2-ETHANEDIOL
lig 95
EDO
B
735 41,2-ETHANEDIOL
lig 96
EDO
B
736 41,2-ETHANEDIOL
lig 97
EDO
B
737 41,2-ETHANEDIOL
lig 98
EDO
B
738 41,2-ETHANEDIOL
lig 99
EDO
B
739 41,2-ETHANEDIOL
lig 100
EDO
B
740 41,2-ETHANEDIOL
lig 101
EDO
B
741 41,2-ETHANEDIOL
lig 102
EDO
B
742 41,2-ETHANEDIOL
lig 103
EDO
B
743 41,2-ETHANEDIOL
lig 104
EDO
B
744 41,2-ETHANEDIOL
lig 105
EDO
B
745 41,2-ETHANEDIOL
lig 106
EDO
B
746 41,2-ETHANEDIOL
lig 107
EDO
B
747 41,2-ETHANEDIOL
lig 108
EDO
B
748 41,2-ETHANEDIOL
lig 109
EDO
B
749 41,2-ETHANEDIOL
lig 110
EDO
B
750 41,2-ETHANEDIOL
lig 111
PEG
B
751 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 112
TRS
B
752 82-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL