Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
8PEJ


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 57 ligands in PDB entry 8PEJ. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
NA
A
601 1SODIUM ION
lig 2
YGX
A
602 12 1,2,3,4,5-PENTOL
lig 3
ACT
A
603 4ACETATE ION
lig 4
NA
A
604 1SODIUM ION
lig 5
NA
A
605 1SODIUM ION
lig 6
NA
A
606 1SODIUM ION
lig 7
NA
B
601 1SODIUM ION
lig 8
YGX
B
602 12 1,2,3,4,5-PENTOL
lig 9
NA
B
603 1SODIUM ION
lig 10
NA
C
601 1SODIUM ION
lig 11
NA
C
602 1SODIUM ION
lig 12
YGX
C
603 12 1,2,3,4,5-PENTOL
lig 13
NA
C
604 1SODIUM ION
lig 14
NA
C
605 1SODIUM ION
lig 15
NA
D
601 1SODIUM ION
lig 16
NA
D
602 1SODIUM ION
lig 17
NA
D
603 1SODIUM ION
lig 18
ACT
D
604 4ACETATE ION
lig 19
YGX
D
605 12 1,2,3,4,5-PENTOL
lig 20
ACT
D
606 4ACETATE ION
lig 21
ACT
D
607 4ACETATE ION
lig 22
NA
D
608 1SODIUM ION
lig 23
NA
D
609 1SODIUM ION
lig 24
NA
E
601 1SODIUM ION
lig 25
NA
E
602 1SODIUM ION
lig 26
NA
E
603 1SODIUM ION
lig 27
YGX
E
604 12 1,2,3,4,5-PENTOL
lig 28
ACT
E
605 4ACETATE ION
lig 29
ACT
E
606 4ACETATE ION
lig 30
NA
E
607 1SODIUM ION
lig 31
NA
E
608 1SODIUM ION
lig 32
NA
E
609 1SODIUM ION
lig 33
NA
F
601 1SODIUM ION
lig 34
NA
F
602 1SODIUM ION
lig 35
NA
F
603 1SODIUM ION
lig 36
YGX
F
604 12 1,2,3,4,5-PENTOL
lig 37
ACT
F
605 4ACETATE ION
lig 38
ACT
F
606 4ACETATE ION
lig 39
NA
F
607 1SODIUM ION
lig 40
NA
G
601 1SODIUM ION
lig 41
NA
G
602 1SODIUM ION
lig 42
YGX
G
603 12 1,2,3,4,5-PENTOL
lig 43
ACT
G
604 4ACETATE ION
lig 44
ACT
G
605 4ACETATE ION
lig 45
ACT
G
606 4ACETATE ION
lig 46
ACT
G
607 4ACETATE ION
lig 47
NA
G
608 1SODIUM ION
lig 48
NA
G
609 1SODIUM ION
lig 49
NA
G
610 1SODIUM ION
lig 50
NA
H
601 1SODIUM ION
lig 51
YGX
H
602 12 1,2,3,4,5-PENTOL
lig 52
ACT
H
603 4ACETATE ION
lig 53
ACT
H
604 4ACETATE ION
lig 54
NA
H
605 1SODIUM ION
lig 55
NA
H
606 1SODIUM ION
lig 56
NA
H
607 1SODIUM ION
lig 57
NA
H
608 1SODIUM ION