Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
8XVR


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 39 ligands in PDB entry 8XVR. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
CA
A
801 1CALCIUM ION
lig 2
CA
A
802 1CALCIUM ION
lig 3
EDO
A
803 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
804 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
805 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
806 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
807 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
GOL
A
808 6GLYCEROL
lig 9
1PE
A
809 16PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 10
CA
B
801 1CALCIUM ION
lig 11
CA
B
802 1CALCIUM ION
lig 12
EDO
B
803 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
B
804 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
B
805 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
B
806 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
B
807 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
B
808 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
B
809 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
GOL
B
810 6GLYCEROL
lig 20
CA
C
801 1CALCIUM ION
lig 21
CA
C
802 1CALCIUM ION
lig 22
EDO
C
803 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
C
804 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
C
805 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
C
806 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
C
807 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
EDO
C
808 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
C
809 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
C
810 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
GOL
C
811 6GLYCEROL
lig 31
GOL
C
812 6GLYCEROL
lig 32
CA
D
801 1CALCIUM ION
lig 33
CA
D
802 1CALCIUM ION
lig 34
EDO
D
803 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
D
804 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
D
805 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
D
806 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
GOL
D
807 6GLYCEROL
lig 39
PEG
D
808 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER