Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
8YUG


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 55 ligands in PDB entry 8YUG. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
GOL
A
601 6GLYCEROL
lig 2
GOL
A
602 6GLYCEROL
lig 3
GOL
A
603 6GLYCEROL
lig 4
ACT
A
604 4ACETATE ION
lig 5
GOL
A
605 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
606 6GLYCEROL
lig 7
GOL
A
607 6GLYCEROL
lig 8
ACT
A
608 4ACETATE ION
lig 9
PO4
A
609 5PHOSPHATE ION
lig 10
GOL
A
610 6GLYCEROL
lig 11
GOL
A
611 6GLYCEROL
lig 12
GOL
A
612 6GLYCEROL
lig 13
PO4
A
613 5PHOSPHATE ION
lig 14
GOL
A
614 6GLYCEROL
lig 15
GOL
A
615 6GLYCEROL
lig 16
GOL
A
616 6GLYCEROL
lig 17
PO4
A
617 5PHOSPHATE ION
lig 18
GOL
A
618 6GLYCEROL
lig 19
GOL
A
619 6GLYCEROL
lig 20
GOL
A
620 6GLYCEROL
lig 21
GOL
A
621 6GLYCEROL
lig 22
PO4
A
622 5PHOSPHATE ION
lig 23
GOL
A
623 6GLYCEROL
lig 24
GOL
A
624 6GLYCEROL
lig 25
GOL
A
625 6GLYCEROL
lig 26
GOL
A
626 6GLYCEROL
lig 27
GOL
A
627 6GLYCEROL
lig 28
GOL
A
628 6GLYCEROL
lig 29
GOL
A
629 6GLYCEROL
lig 30
GOL
A
630 6GLYCEROL
lig 31
GOL
A
631 6GLYCEROL
lig 32
GOL
A
632 6GLYCEROL
lig 33
GOL
A
633 6GLYCEROL
lig 34
ACT
A
634 4ACETATE ION
lig 35
ACT
A
635 4ACETATE ION
lig 36
ACT
A
636 4ACETATE ION
lig 37
ACT
A
637 4ACETATE ION
lig 38
ACT
A
638 4ACETATE ION
lig 39
ACT
A
639 4ACETATE ION
lig 40
ACT
A
640 4ACETATE ION
lig 41
ACT
A
641 4ACETATE ION
lig 42
ACT
A
642 4ACETATE ION
lig 43
ACT
A
643 4ACETATE ION
lig 44
ACT
A
644 4ACETATE ION
lig 45
ACT
A
645 4ACETATE ION
lig 46
ACT
A
646 4ACETATE ION
lig 47
GOL
A
647 6GLYCEROL
lig 48
GOL
A
648 6GLYCEROL
lig 49
GOL
A
649 6GLYCEROL
lig 50
GOL
A
650 6GLYCEROL
lig 51
GOL
A
651 6GLYCEROL
lig 52
GOL
A
652 6GLYCEROL
lig 53
GOL
A
653 6GLYCEROL
lig 54
GOL
A
654 6GLYCEROL
lig 55
ACT
A
655 4ACETATE ION