Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
8YUI


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 98 ligands in PDB entry 8YUI. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
NAG
C
1 152-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 2
NAG
C
2 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 3
NAG
D
1 152-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 4
NAG
D
2 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 5
GOL
A
601 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
602 6GLYCEROL
lig 7
GOL
A
603 6GLYCEROL
lig 8
GOL
A
604 6GLYCEROL
lig 9
GOL
A
605 6GLYCEROL
lig 10
GOL
A
606 6GLYCEROL
lig 11
GOL
A
607 6GLYCEROL
lig 12
GOL
A
608 6GLYCEROL
lig 13
GOL
A
609 6GLYCEROL
lig 14
NGO
A
610 14 GLUCOPYRANOSO)[2,1-D]-1,3-OXAZOLE
lig 15
GOL
A
611 6GLYCEROL
lig 16
GOL
A
612 6GLYCEROL
lig 17
GOL
A
613 6GLYCEROL
lig 18
GOL
A
614 6GLYCEROL
lig 19
GOL
A
615 6GLYCEROL
lig 20
GOL
A
616 6GLYCEROL
lig 21
GOL
A
617 6GLYCEROL
lig 22
GOL
A
618 6GLYCEROL
lig 23
GOL
A
619 6GLYCEROL
lig 24
GOL
A
620 6GLYCEROL
lig 25
GOL
A
621 6GLYCEROL
lig 26
GOL
A
622 6GLYCEROL
lig 27
GOL
A
623 6GLYCEROL
lig 28
GOL
A
624 6GLYCEROL
lig 29
GOL
A
625 6GLYCEROL
lig 30
GOL
A
626 6GLYCEROL
lig 31
ACT
A
627 4ACETATE ION
lig 32
GOL
A
628 6GLYCEROL
lig 33
GOL
A
629 6GLYCEROL
lig 34
ACT
A
630 4ACETATE ION
lig 35
ACT
A
631 4ACETATE ION
lig 36
ACT
A
632 4ACETATE ION
lig 37
ACT
A
633 4ACETATE ION
lig 38
GOL
A
634 6GLYCEROL
lig 39
ACT
A
635 4ACETATE ION
lig 40
GOL
A
636 6GLYCEROL
lig 41
GOL
A
637 6GLYCEROL
lig 42
GOL
A
638 6GLYCEROL
lig 43
ACT
A
639 4ACETATE ION
lig 44
ACT
A
640 4ACETATE ION
lig 45
ACT
A
641 4ACETATE ION
lig 46
GOL
A
642 6GLYCEROL
lig 47
ACT
A
643 4ACETATE ION
lig 48
GOL
A
644 6GLYCEROL
lig 49
GOL
A
645 6GLYCEROL
lig 50
PO4
A
646 5PHOSPHATE ION
lig 51
PO4
A
647 5PHOSPHATE ION
lig 52
ACT
A
648 4ACETATE ION
lig 53
GOL
B
601 6GLYCEROL
lig 54
GOL
B
602 6GLYCEROL
lig 55
GOL
B
603 6GLYCEROL
lig 56
GOL
B
604 6GLYCEROL
lig 57
GOL
B
605 6GLYCEROL
lig 58
GOL
B
606 6GLYCEROL
lig 59
GOL
B
607 6GLYCEROL
lig 60
PO4
B
608 5PHOSPHATE ION
lig 61
GOL
B
609 6GLYCEROL
lig 62
GOL
B
610 6GLYCEROL
lig 63
NGO
B
611 14 GLUCOPYRANOSO)[2,1-D]-1,3-OXAZOLE
lig 64
GOL
B
612 6GLYCEROL
lig 65
GOL
B
613 6GLYCEROL
lig 66
GOL
B
614 6GLYCEROL
lig 67
GOL
B
615 6GLYCEROL
lig 68
GOL
B
616 6GLYCEROL
lig 69
GOL
B
617 6GLYCEROL
lig 70
GOL
B
618 6GLYCEROL
lig 71
GOL
B
619 6GLYCEROL
lig 72
GOL
B
620 6GLYCEROL
lig 73
GOL
B
621 6GLYCEROL
lig 74
GOL
B
622 6GLYCEROL
lig 75
GOL
B
623 6GLYCEROL
lig 76
GOL
B
624 6GLYCEROL
lig 77
GOL
B
625 6GLYCEROL
lig 78
GOL
B
626 6GLYCEROL
lig 79
GOL
B
627 6GLYCEROL
lig 80
ACT
B
628 4ACETATE ION
lig 81
GOL
B
629 6GLYCEROL
lig 82
ACT
B
630 4ACETATE ION
lig 83
ACT
B
631 4ACETATE ION
lig 84
ACT
B
632 4ACETATE ION
lig 85
GOL
B
633 6GLYCEROL
lig 86
GOL
B
634 6GLYCEROL
lig 87
ACT
B
635 4ACETATE ION
lig 88
ACT
B
636 4ACETATE ION
lig 89
GOL
B
637 6GLYCEROL
lig 90
ACT
B
638 4ACETATE ION
lig 91
ACT
B
639 4ACETATE ION
lig 92
GOL
B
640 6GLYCEROL
lig 93
ACT
B
641 4ACETATE ION
lig 94
GOL
B
642 6GLYCEROL
lig 95
ACT
B
643 4ACETATE ION
lig 96
PO4
B
644 5PHOSPHATE ION
lig 97
ACT
B
645 4ACETATE ION
lig 98
GOL
B
646 6GLYCEROL