Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
9BKX


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 158 ligands in PDB entry 9BKX. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
1PE
A
301 13PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 2
2PE
A
302 10NONAETHYLENE GLYCOL
lig 3
1PE
A
303 7PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 4
GOL
A
304 6GLYCEROL
lig 5
GOL
A
305 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
306 6GLYCEROL
lig 7
GOL
A
307 6GLYCEROL
lig 8
GOL
A
308 6GLYCEROL
lig 9
GOL
B
301 6GLYCEROL
lig 10
GOL
B
302 6GLYCEROL
lig 11
1PE
B
303 10PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 12
1PE
B
304 10PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 13
1PE
B
305 16PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 14
GOL
B
306 6GLYCEROL
lig 15
GOL
B
307 6GLYCEROL
lig 16
GOL
B
308 6GLYCEROL
lig 17
NI
B
309 1NICKEL (II) ION
lig 18
1PE
C
301 10PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 19
1PE
C
302 16PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 20
1PE
C
303 16PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 21
NI
C
304 1NICKEL (II) ION
lig 22
GOL
C
305 6GLYCEROL
lig 23
GOL
C
306 6GLYCEROL
lig 24
NI
C
307 1NICKEL (II) ION
lig 25
NI
C
308 1NICKEL (II) ION
lig 26
NI
C
309 1NICKEL (II) ION
lig 27
GOL
D
301 6GLYCEROL
lig 28
GOL
D
302 6GLYCEROL
lig 29
GOL
D
303 6GLYCEROL
lig 30
GOL
D
304 6GLYCEROL
lig 31
GOL
D
305 6GLYCEROL
lig 32
NI
D
306 1NICKEL (II) ION
lig 33
NI
D
307 1NICKEL (II) ION
lig 34
1PE
E
301 16PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 35
1PE
E
302 10PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 36
GOL
E
303 6GLYCEROL
lig 37
GOL
E
304 6GLYCEROL
lig 38
GOL
E
305 6GLYCEROL
lig 39
GOL
E
306 6GLYCEROL
lig 40
NI
E
307 1NICKEL (II) ION
lig 41
NI
E
308 1NICKEL (II) ION
lig 42
1PE
F
301 13PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 43
1PE
F
302 16PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 44
1PE
F
303 13PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 45
1PE
F
304 16PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 46
GOL
F
305 6GLYCEROL
lig 47
GOL
F
306 6GLYCEROL
lig 48
GOL
F
307 6GLYCEROL
lig 49
NI
F
308 1NICKEL (II) ION
lig 50
NI
F
309 1NICKEL (II) ION
lig 51
1PE
G
301 10PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 52
GOL
G
302 6GLYCEROL
lig 53
1PE
H
301 16PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 54
1PE
H
302 10PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 55
2PE
H
303 25NONAETHYLENE GLYCOL
lig 56
2PE
H
304 22NONAETHYLENE GLYCOL
lig 57
1PE
H
305 10PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 58
NI
H
306 1NICKEL (II) ION
lig 59
GOL
H
307 6GLYCEROL
lig 60
GOL
H
308 6GLYCEROL
lig 61
GOL
H
309 6GLYCEROL
lig 62
GOL
H
310 6GLYCEROL
lig 63
GOL
H
311 6GLYCEROL
lig 64
NI
H
312 1NICKEL (II) ION
lig 65
1PE
I
301 16PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 66
1PE
I
302 10PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 67
1PE
I
303 10PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 68
NI
I
304 1NICKEL (II) ION
lig 69
GOL
I
305 6GLYCEROL
lig 70
GOL
I
306 6GLYCEROL
lig 71
GOL
I
307 6GLYCEROL
lig 72
GOL
I
308 6GLYCEROL
lig 73
GOL
I
309 6GLYCEROL
lig 74
GOL
I
310 6GLYCEROL
lig 75
NI
I
311 1NICKEL (II) ION
lig 76
1PE
J
301 10PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 77
2PE
J
302 16NONAETHYLENE GLYCOL
lig 78
1PE
J
303 16PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 79
GOL
J
304 6GLYCEROL
lig 80
GOL
J
305 6GLYCEROL
lig 81
GOL
J
306 6GLYCEROL
lig 82
GOL
J
307 6GLYCEROL
lig 83
NI
J
308 1NICKEL (II) ION
lig 84
NI
J
309 1NICKEL (II) ION
lig 85
1PE
K
301 10PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 86
1PE
K
302 13PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 87
GOL
K
303 6GLYCEROL
lig 88
GOL
K
304 6GLYCEROL
lig 89
GOL
K
305 6GLYCEROL
lig 90
GOL
K
306 6GLYCEROL
lig 91
GOL
K
307 6GLYCEROL
lig 92
GOL
K
308 6GLYCEROL
lig 93
NI
K
309 1NICKEL (II) ION
lig 94
GOL
L
301 6GLYCEROL
lig 95
2PE
L
302 25NONAETHYLENE GLYCOL
lig 96
1PE
L
303 16PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 97
1PE
L
304 13PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 98
1PE
L
305 16PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 99
GOL
L
306 6GLYCEROL
lig 100
GOL
L
307 6GLYCEROL
lig 101
GOL
L
308 6GLYCEROL
lig 102
NI
L
309 1NICKEL (II) ION
lig 103
NI
L
310 1NICKEL (II) ION
lig 104
GOL
M
301 6GLYCEROL
lig 105
GOL
M
302 6GLYCEROL
lig 106
GOL
M
303 6GLYCEROL
lig 107
NI
M
304 1NICKEL (II) ION
lig 108
1PE
N
301 10PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 109
1PE
N
302 10PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 110
1PE
N
303 13PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 111
GOL
N
304 6GLYCEROL
lig 112
GOL
N
305 6GLYCEROL
lig 113
NI
N
306 1NICKEL (II) ION
lig 114
1PE
O
301 10PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 115
GOL
O
302 6GLYCEROL
lig 116
GOL
O
303 6GLYCEROL
lig 117
GOL
O
304 6GLYCEROL
lig 118
GOL
O
305 6GLYCEROL
lig 119
GOL
O
306 6GLYCEROL
lig 120
GOL
O
307 6GLYCEROL
lig 121
NI
O
308 1NICKEL (II) ION
lig 122
NI
O
309 1NICKEL (II) ION
lig 123
NI
O
310 1NICKEL (II) ION
lig 124
1PE
P
301 13PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 125
1PE
P
302 13PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 126
NI
P
303 1NICKEL (II) ION
lig 127
NI
P
304 1NICKEL (II) ION
lig 128
1PE
Q
301 16PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 129
1PE
Q
302 10PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 130
GOL
Q
303 6GLYCEROL
lig 131
GOL
Q
304 6GLYCEROL
lig 132
GOL
Q
305 6GLYCEROL
lig 133
NI
Q
306 1NICKEL (II) ION
lig 134
NI
Q
307 1NICKEL (II) ION
lig 135
1PE
R
301 10PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 136
1PE
R
302 7PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 137
1PE
R
303 13PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 138
GOL
R
304 6GLYCEROL
lig 139
GOL
R
305 6GLYCEROL
lig 140
GOL
R
306 6GLYCEROL
lig 141
GOL
R
307 6GLYCEROL
lig 142
NI
R
308 1NICKEL (II) ION
lig 143
GOL
S
301 6GLYCEROL
lig 144
GOL
S
302 6GLYCEROL
lig 145
GOL
S
303 6GLYCEROL
lig 146
GOL
S
304 6GLYCEROL
lig 147
GOL
S
305 6GLYCEROL
lig 148
GOL
S
306 6GLYCEROL
lig 149
NI
S
307 1NICKEL (II) ION
lig 150
NI
S
308 1NICKEL (II) ION
lig 151
NI
S
309 1NICKEL (II) ION
lig 152
12P
T
301 13DODECAETHYLENE GLYCOL
lig 153
1PE
T
302 16PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 154
1PE
T
303 10PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 155
GOL
T
304 6GLYCEROL
lig 156
GOL
T
305 6GLYCEROL
lig 157
GOL
T
306 6GLYCEROL
lig 158
GOL
T
307 6GLYCEROL