Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
9GDJ


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 45 ligands in PDB entry 9GDJ. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
NCO
A
301 5COBALT HEXAMMINE(III)
lig 2
PGE
A
302 5TRIETHYLENE GLYCOL
lig 3
PGE
A
303 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 4
PGE
A
304 4TRIETHYLENE GLYCOL
lig 5
GOL
A
305 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
306 6GLYCEROL
lig 7
GOL
A
307 6GLYCEROL
lig 8
GOL
A
308 6GLYCEROL
lig 9
GOL
A
309 6GLYCEROL
lig 10
GOL
A
310 6GLYCEROL
lig 11
GOL
A
311 6GLYCEROL
lig 12
GOL
A
312 6GLYCEROL
lig 13
GOL
A
313 6GLYCEROL
lig 14
IPA
A
314 4ISOPROPYL ALCOHOL
lig 15
IPA
A
315 4ISOPROPYL ALCOHOL
lig 16
IPA
A
316 4ISOPROPYL ALCOHOL
lig 17
SAH
A
317 26S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
lig 18
CL
B
301 1CHLORIDE ION
lig 19
GOL
B
302 6GLYCEROL
lig 20
GOL
B
303 6GLYCEROL
lig 21
GOL
B
304 6GLYCEROL
lig 22
GOL
B
305 6GLYCEROL
lig 23
GOL
B
306 6GLYCEROL
lig 24
GOL
B
307 6GLYCEROL
lig 25
GOL
B
308 6GLYCEROL
lig 26
IPA
B
309 4ISOPROPYL ALCOHOL
lig 27
SAH
B
310 26S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
lig 28
GOL
C
301 6GLYCEROL
lig 29
IPA
C
302 4ISOPROPYL ALCOHOL
lig 30
PGE
C
303 9TRIETHYLENE GLYCOL
lig 31
PGE
C
304 8TRIETHYLENE GLYCOL
lig 32
GOL
C
305 6GLYCEROL
lig 33
GOL
C
306 6GLYCEROL
lig 34
GOL
C
307 6GLYCEROL
lig 35
GOL
C
308 6GLYCEROL
lig 36
GOL
C
309 6GLYCEROL
lig 37
GOL
C
310 6GLYCEROL
lig 38
GOL
C
311 6GLYCEROL
lig 39
GOL
C
312 6GLYCEROL
lig 40
GOL
C
313 6GLYCEROL
lig 41
GOL
C
314 6GLYCEROL
lig 42
GOL
C
315 6GLYCEROL
lig 43
IPA
C
316 4ISOPROPYL ALCOHOL
lig 44
IPA
C
317 4ISOPROPYL ALCOHOL
lig 45
SAH
C
318 26S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE