Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
9JF5


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 165 ligands in PDB entry 9JF5. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
PYR
E
502 4PYRUVIC ACID
lig 2
PYR
F
502 4PYRUVIC ACID
lig 3
PYR
G
502 4PYRUVIC ACID
lig 4
PYR
H
502 4PYRUVIC ACID
lig 5
PEG
A
501 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 6
PEG
A
502 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 7
EDO
A
503 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
504 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
505 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
506 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
507 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
A
508 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
A
509 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
A
510 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
A
511 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
A
512 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
A
513 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
A
514 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
A
515 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
A
516 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
A
517 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
EDO
A
518 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
A
519 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
A
520 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
A
521 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
A
522 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
EDO
A
523 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
A
524 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
A
525 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
EDO
A
526 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
EDO
A
527 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
A
528 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
EDO
A
529 41,2-ETHANEDIOL
lig 34
EDO
A
530 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
A
531 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
A
532 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
A
533 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
A
534 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
A
535 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
EDO
A
536 41,2-ETHANEDIOL
lig 41
AG2
E
601 9AGMATINE
lig 42
EDO
E
602 41,2-ETHANEDIOL
lig 43
EDO
E
603 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
EDO
E
604 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
PEG
B
501 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 46
PEG
B
502 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 47
PEG
B
503 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 48
EDO
B
504 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
EDO
B
505 41,2-ETHANEDIOL
lig 50
EDO
B
506 41,2-ETHANEDIOL
lig 51
EDO
B
507 41,2-ETHANEDIOL
lig 52
EDO
B
508 41,2-ETHANEDIOL
lig 53
EDO
B
509 41,2-ETHANEDIOL
lig 54
EDO
B
510 41,2-ETHANEDIOL
lig 55
EDO
B
511 41,2-ETHANEDIOL
lig 56
EDO
B
512 41,2-ETHANEDIOL
lig 57
EDO
B
513 41,2-ETHANEDIOL
lig 58
EDO
B
514 41,2-ETHANEDIOL
lig 59
EDO
B
515 41,2-ETHANEDIOL
lig 60
EDO
B
516 41,2-ETHANEDIOL
lig 61
EDO
B
517 41,2-ETHANEDIOL
lig 62
EDO
B
518 41,2-ETHANEDIOL
lig 63
EDO
B
519 41,2-ETHANEDIOL
lig 64
EDO
B
520 41,2-ETHANEDIOL
lig 65
EDO
B
521 41,2-ETHANEDIOL
lig 66
EDO
B
522 41,2-ETHANEDIOL
lig 67
EDO
B
523 41,2-ETHANEDIOL
lig 68
EDO
B
524 41,2-ETHANEDIOL
lig 69
EDO
B
525 41,2-ETHANEDIOL
lig 70
EDO
B
526 41,2-ETHANEDIOL
lig 71
EDO
B
527 41,2-ETHANEDIOL
lig 72
EDO
B
528 41,2-ETHANEDIOL
lig 73
EDO
B
529 41,2-ETHANEDIOL
lig 74
EDO
B
530 41,2-ETHANEDIOL
lig 75
EDO
B
531 41,2-ETHANEDIOL
lig 76
EDO
B
532 41,2-ETHANEDIOL
lig 77
EDO
B
533 41,2-ETHANEDIOL
lig 78
EDO
B
534 41,2-ETHANEDIOL
lig 79
EDO
B
535 41,2-ETHANEDIOL
lig 80
EDO
B
536 41,2-ETHANEDIOL
lig 81
EDO
B
537 41,2-ETHANEDIOL
lig 82
EDO
B
538 41,2-ETHANEDIOL
lig 83
EDO
B
539 41,2-ETHANEDIOL
lig 84
EDO
B
540 41,2-ETHANEDIOL
lig 85
EDO
B
541 41,2-ETHANEDIOL
lig 86
AG2
F
601 9AGMATINE
lig 87
EDO
F
602 41,2-ETHANEDIOL
lig 88
PEG
C
501 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 89
PEG
C
502 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 90
PEG
C
503 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 91
EDO
C
504 41,2-ETHANEDIOL
lig 92
EDO
C
505 41,2-ETHANEDIOL
lig 93
EDO
C
506 41,2-ETHANEDIOL
lig 94
EDO
C
507 41,2-ETHANEDIOL
lig 95
EDO
C
508 41,2-ETHANEDIOL
lig 96
EDO
C
509 41,2-ETHANEDIOL
lig 97
EDO
C
510 41,2-ETHANEDIOL
lig 98
EDO
C
511 41,2-ETHANEDIOL
lig 99
EDO
C
512 41,2-ETHANEDIOL
lig 100
EDO
C
513 41,2-ETHANEDIOL
lig 101
EDO
C
514 41,2-ETHANEDIOL
lig 102
EDO
C
515 41,2-ETHANEDIOL
lig 103
EDO
C
516 41,2-ETHANEDIOL
lig 104
EDO
C
517 41,2-ETHANEDIOL
lig 105
EDO
C
518 41,2-ETHANEDIOL
lig 106
EDO
C
519 41,2-ETHANEDIOL
lig 107
EDO
C
520 41,2-ETHANEDIOL
lig 108
EDO
C
521 41,2-ETHANEDIOL
lig 109
EDO
C
522 41,2-ETHANEDIOL
lig 110
EDO
C
523 41,2-ETHANEDIOL
lig 111
EDO
C
524 41,2-ETHANEDIOL
lig 112
EDO
C
525 41,2-ETHANEDIOL
lig 113
EDO
C
526 41,2-ETHANEDIOL
lig 114
EDO
C
527 41,2-ETHANEDIOL
lig 115
EDO
C
528 41,2-ETHANEDIOL
lig 116
EDO
C
529 41,2-ETHANEDIOL
lig 117
EDO
C
530 41,2-ETHANEDIOL
lig 118
EDO
C
531 41,2-ETHANEDIOL
lig 119
EDO
C
532 41,2-ETHANEDIOL
lig 120
EDO
C
533 41,2-ETHANEDIOL
lig 121
EDO
C
534 41,2-ETHANEDIOL
lig 122
EDO
C
535 41,2-ETHANEDIOL
lig 123
EDO
C
536 41,2-ETHANEDIOL
lig 124
EDO
C
537 41,2-ETHANEDIOL
lig 125
AG2
G
601 9AGMATINE
lig 126
EDO
G
602 41,2-ETHANEDIOL
lig 127
EDO
G
603 41,2-ETHANEDIOL
lig 128
PEG
D
501 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 129
EDO
D
502 41,2-ETHANEDIOL
lig 130
EDO
D
503 41,2-ETHANEDIOL
lig 131
EDO
D
504 41,2-ETHANEDIOL
lig 132
EDO
D
505 41,2-ETHANEDIOL
lig 133
EDO
D
506 41,2-ETHANEDIOL
lig 134
EDO
D
507 41,2-ETHANEDIOL
lig 135
EDO
D
508 41,2-ETHANEDIOL
lig 136
EDO
D
509 41,2-ETHANEDIOL
lig 137
EDO
D
510 41,2-ETHANEDIOL
lig 138
EDO
D
511 41,2-ETHANEDIOL
lig 139
EDO
D
512 41,2-ETHANEDIOL
lig 140
EDO
D
513 41,2-ETHANEDIOL
lig 141
EDO
D
514 41,2-ETHANEDIOL
lig 142
EDO
D
515 41,2-ETHANEDIOL
lig 143
EDO
D
516 41,2-ETHANEDIOL
lig 144
EDO
D
517 41,2-ETHANEDIOL
lig 145
EDO
D
518 41,2-ETHANEDIOL
lig 146
EDO
D
519 41,2-ETHANEDIOL
lig 147
EDO
D
520 41,2-ETHANEDIOL
lig 148
EDO
D
521 41,2-ETHANEDIOL
lig 149
EDO
D
522 41,2-ETHANEDIOL
lig 150
EDO
D
523 41,2-ETHANEDIOL
lig 151
EDO
D
524 41,2-ETHANEDIOL
lig 152
EDO
D
525 41,2-ETHANEDIOL
lig 153
EDO
D
526 41,2-ETHANEDIOL
lig 154
EDO
D
527 41,2-ETHANEDIOL
lig 155
EDO
D
528 41,2-ETHANEDIOL
lig 156
EDO
D
529 41,2-ETHANEDIOL
lig 157
EDO
D
530 41,2-ETHANEDIOL
lig 158
EDO
D
531 41,2-ETHANEDIOL
lig 159
EDO
D
532 41,2-ETHANEDIOL
lig 160
EDO
D
533 41,2-ETHANEDIOL
lig 161
EDO
D
534 41,2-ETHANEDIOL
lig 162
EDO
D
535 41,2-ETHANEDIOL
lig 163
AG2
H
601 9AGMATINE
lig 164
EDO
H
602 41,2-ETHANEDIOL
lig 165
EDO
H
603 41,2-ETHANEDIOL