Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
9JOU


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 35 ligands in PDB entry 9JOU. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
RET
A
301 20RETINAL
lig 2
R16
A
302 16HEXADECANE
lig 3
R16
A
303 16HEXADECANE
lig 4
D12
A
304 12DODECANE
lig 5
D12
A
305 12DODECANE
lig 6
K3I
A
306 42ZEAXANTHIN
lig 7
D12
A
307 12DODECANE
lig 8
D12
B
301 12DODECANE
lig 9
RET
B
302 20RETINAL
lig 10
R16
B
303 16HEXADECANE
lig 11
D12
B
304 12DODECANE
lig 12
D12
B
305 12DODECANE
lig 13
K3I
B
306 42ZEAXANTHIN
lig 14
R16
C
301 16HEXADECANE
lig 15
R16
C
302 16HEXADECANE
lig 16
RET
C
303 20RETINAL
lig 17
R16
C
304 16HEXADECANE
lig 18
R16
C
305 16HEXADECANE
lig 19
D12
C
306 12DODECANE
lig 20
D12
C
307 12DODECANE
lig 21
K3I
C
308 42ZEAXANTHIN
lig 22
R16
D
301 16HEXADECANE
lig 23
RET
D
302 20RETINAL
lig 24
R16
D
303 16HEXADECANE
lig 25
R16
D
304 16HEXADECANE
lig 26
R16
D
305 16HEXADECANE
lig 27
D12
D
306 12DODECANE
lig 28
K3I
D
307 42ZEAXANTHIN
lig 29
D12
E
301 12DODECANE
lig 30
RET
E
302 20RETINAL
lig 31
R16
E
303 16HEXADECANE
lig 32
R16
E
304 16HEXADECANE
lig 33
D12
E
305 12DODECANE
lig 34
D12
E
306 12DODECANE
lig 35
K3I
E
307 42ZEAXANTHIN