Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
9NTE


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 169 ligands in PDB entry 9NTE. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
NAG
E
1 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 2
NAG
E
2 152-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 3
NAG
F
1 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 4
NAG
F
2 152-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 5
EDO
A
601 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
NAG
A
602 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 7
NAG
A
603 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 8
NAG
A
604 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 9
EDO
A
605 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
606 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
BTB
A
607 14 PROPANE-1,3-DIOL
lig 12
EDO
A
608 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
A
609 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
A
610 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
A
611 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
A
612 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
A
613 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
A
614 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
A
615 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
A
616 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
A
617 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
EDO
A
618 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
A
619 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
A
620 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
A
621 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
A
622 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
GOL
A
623 6GLYCEROL
lig 28
EDO
A
624 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
A
625 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
PEG
A
626 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 31
EDO
A
627 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
A
628 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
EDO
A
629 41,2-ETHANEDIOL
lig 34
GOL
A
630 6GLYCEROL
lig 35
EDO
A
631 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
A
632 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
A
633 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
GOL
A
634 6GLYCEROL
lig 39
EDO
A
635 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
PEG
A
636 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 41
EDO
A
637 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
EDO
A
638 41,2-ETHANEDIOL
lig 43
EDO
A
639 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
EDO
A
640 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
EDO
A
641 41,2-ETHANEDIOL
lig 46
EDO
A
642 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
EDO
A
643 41,2-ETHANEDIOL
lig 48
EDO
A
644 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
GOL
A
645 6GLYCEROL
lig 50
PEG
A
646 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 51
ZN
A
647 1ZINC ION
lig 52
GOL
B
601 6GLYCEROL
lig 53
EDO
B
602 41,2-ETHANEDIOL
lig 54
EDO
B
603 41,2-ETHANEDIOL
lig 55
NAG
B
604 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 56
NAG
B
605 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 57
NAG
B
606 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 58
NAG
B
607 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 59
EDO
B
608 41,2-ETHANEDIOL
lig 60
EDO
B
609 41,2-ETHANEDIOL
lig 61
EDO
B
610 41,2-ETHANEDIOL
lig 62
EDO
B
611 41,2-ETHANEDIOL
lig 63
EDO
B
612 41,2-ETHANEDIOL
lig 64
BTB
B
613 14 PROPANE-1,3-DIOL
lig 65
EDO
B
614 41,2-ETHANEDIOL
lig 66
EDO
B
615 41,2-ETHANEDIOL
lig 67
EDO
B
616 41,2-ETHANEDIOL
lig 68
EDO
B
617 41,2-ETHANEDIOL
lig 69
EDO
B
618 41,2-ETHANEDIOL
lig 70
EDO
B
619 41,2-ETHANEDIOL
lig 71
EDO
B
620 41,2-ETHANEDIOL
lig 72
EDO
B
621 41,2-ETHANEDIOL
lig 73
EDO
B
622 41,2-ETHANEDIOL
lig 74
EDO
B
623 41,2-ETHANEDIOL
lig 75
EDO
B
624 41,2-ETHANEDIOL
lig 76
EDO
B
625 41,2-ETHANEDIOL
lig 77
EDO
B
626 41,2-ETHANEDIOL
lig 78
GOL
B
627 6GLYCEROL
lig 79
EDO
B
628 41,2-ETHANEDIOL
lig 80
EDO
B
629 41,2-ETHANEDIOL
lig 81
GOL
B
630 6GLYCEROL
lig 82
EDO
B
631 41,2-ETHANEDIOL
lig 83
EDO
B
632 41,2-ETHANEDIOL
lig 84
EDO
B
633 41,2-ETHANEDIOL
lig 85
EDO
B
634 41,2-ETHANEDIOL
lig 86
GOL
B
635 6GLYCEROL
lig 87
EDO
B
636 41,2-ETHANEDIOL
lig 88
EDO
B
637 41,2-ETHANEDIOL
lig 89
EDO
B
638 41,2-ETHANEDIOL
lig 90
EDO
B
639 41,2-ETHANEDIOL
lig 91
EDO
B
640 41,2-ETHANEDIOL
lig 92
PEG
B
641 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 93
EDO
B
642 41,2-ETHANEDIOL
lig 94
PGE
B
643 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 95
PEG
B
644 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 96
EDO
B
645 41,2-ETHANEDIOL
lig 97
PEG
B
646 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 98
EDO
B
647 41,2-ETHANEDIOL
lig 99
NAG
B
648 152-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 100
EDO
B
649 41,2-ETHANEDIOL
lig 101
EDO
B
650 41,2-ETHANEDIOL
lig 102
GOL
B
651 6GLYCEROL
lig 103
ZN
B
652 1ZINC ION
lig 104
EDO
B
653 41,2-ETHANEDIOL
lig 105
EDO
B
654 41,2-ETHANEDIOL
lig 106
GOL
C
601 6GLYCEROL
lig 107
GOL
C
602 6GLYCEROL
lig 108
GOL
C
603 6GLYCEROL
lig 109
EDO
C
604 41,2-ETHANEDIOL
lig 110
NAG
C
605 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 111
NAG
C
606 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 112
EDO
C
607 41,2-ETHANEDIOL
lig 113
EDO
C
608 41,2-ETHANEDIOL
lig 114
EDO
C
609 41,2-ETHANEDIOL
lig 115
EDO
C
610 41,2-ETHANEDIOL
lig 116
EDO
C
611 41,2-ETHANEDIOL
lig 117
EDO
C
612 41,2-ETHANEDIOL
lig 118
EDO
C
613 41,2-ETHANEDIOL
lig 119
EDO
C
614 41,2-ETHANEDIOL
lig 120
EDO
C
615 41,2-ETHANEDIOL
lig 121
EDO
C
616 41,2-ETHANEDIOL
lig 122
EDO
C
617 41,2-ETHANEDIOL
lig 123
EDO
C
618 41,2-ETHANEDIOL
lig 124
EDO
C
619 41,2-ETHANEDIOL
lig 125
EDO
C
620 41,2-ETHANEDIOL
lig 126
EDO
C
621 41,2-ETHANEDIOL
lig 127
EDO
C
622 41,2-ETHANEDIOL
lig 128
EDO
C
623 41,2-ETHANEDIOL
lig 129
GOL
C
624 6GLYCEROL
lig 130
PGE
C
625 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 131
GOL
C
626 6GLYCEROL
lig 132
PEG
C
627 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 133
EDO
C
628 41,2-ETHANEDIOL
lig 134
EDO
C
629 41,2-ETHANEDIOL
lig 135
EDO
C
630 41,2-ETHANEDIOL
lig 136
GOL
C
631 6GLYCEROL
lig 137
ZN
C
632 1ZINC ION
lig 138
EDO
C
633 41,2-ETHANEDIOL
lig 139
EDO
D
601 41,2-ETHANEDIOL
lig 140
NAG
D
602 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 141
NAG
D
603 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 142
NAG
D
604 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 143
NAG
D
605 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 144
EDO
D
606 41,2-ETHANEDIOL
lig 145
EDO
D
607 41,2-ETHANEDIOL
lig 146
EDO
D
608 41,2-ETHANEDIOL
lig 147
EDO
D
609 41,2-ETHANEDIOL
lig 148
EDO
D
610 41,2-ETHANEDIOL
lig 149
EDO
D
611 41,2-ETHANEDIOL
lig 150
EDO
D
612 41,2-ETHANEDIOL
lig 151
EDO
D
613 41,2-ETHANEDIOL
lig 152
PEG
D
614 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 153
EDO
D
615 41,2-ETHANEDIOL
lig 154
EDO
D
616 41,2-ETHANEDIOL
lig 155
PEG
D
617 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 156
EDO
D
618 41,2-ETHANEDIOL
lig 157
EDO
D
619 41,2-ETHANEDIOL
lig 158
EDO
D
620 41,2-ETHANEDIOL
lig 159
EDO
D
621 41,2-ETHANEDIOL
lig 160
EDO
D
622 41,2-ETHANEDIOL
lig 161
EDO
D
623 41,2-ETHANEDIOL
lig 162
PEG
D
624 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 163
EDO
D
625 41,2-ETHANEDIOL
lig 164
EDO
D
626 41,2-ETHANEDIOL
lig 165
EDO
D
627 41,2-ETHANEDIOL
lig 166
EDO
D
628 41,2-ETHANEDIOL
lig 167
EDO
D
629 41,2-ETHANEDIOL
lig 168
ZN
D
630 1ZINC ION
lig 169
EDO
D
631 41,2-ETHANEDIOL