Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
9WT8


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 145 ligands in PDB entry 9WT8. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
HEC
A
501 43HEME C
lig 2
HEC
A
502 43HEME C
lig 3
HEC
A
503 43HEME C
lig 4
HEC
A
504 43HEME C
lig 5
HEC
A
505 43HEME C
lig 6
SO4
A
506 5SULFATE ION
lig 7
SO4
A
507 5SULFATE ION
lig 8
SO4
A
508 5SULFATE ION
lig 9
SO4
A
509 5SULFATE ION
lig 10
EDO
A
510 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
511 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
A
512 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
A
513 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
A
514 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
A
515 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
A
516 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
A
517 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
A
518 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
A
519 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
A
520 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
A
521 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
EDO
A
522 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
A
523 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
A
524 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
A
525 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
A
526 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
EDO
A
527 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
A
528 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
A
529 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
EDO
A
530 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
EDO
A
531 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
A
532 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
SO4
A
533 5SULFATE ION
lig 34
EDO
A
534 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
A
535 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
A
536 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
A
537 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
A
538 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
B
501 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
HEC
B
502 43HEME C
lig 41
HEC
B
503 43HEME C
lig 42
HEC
B
504 43HEME C
lig 43
HEC
B
505 43HEME C
lig 44
HEC
B
506 43HEME C
lig 45
SO4
B
507 5SULFATE ION
lig 46
SO4
B
508 5SULFATE ION
lig 47
SO4
B
509 5SULFATE ION
lig 48
SO4
B
510 5SULFATE ION
lig 49
SO4
B
511 5SULFATE ION
lig 50
SO4
B
512 5SULFATE ION
lig 51
EPE
B
513 154-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULF
lig 52
EDO
B
514 41,2-ETHANEDIOL
lig 53
EDO
B
515 41,2-ETHANEDIOL
lig 54
EDO
B
516 41,2-ETHANEDIOL
lig 55
EDO
B
517 41,2-ETHANEDIOL
lig 56
EDO
B
518 41,2-ETHANEDIOL
lig 57
EDO
B
519 41,2-ETHANEDIOL
lig 58
EDO
B
520 41,2-ETHANEDIOL
lig 59
EDO
B
521 41,2-ETHANEDIOL
lig 60
EDO
B
522 41,2-ETHANEDIOL
lig 61
EDO
B
523 41,2-ETHANEDIOL
lig 62
EDO
B
524 41,2-ETHANEDIOL
lig 63
EDO
B
525 41,2-ETHANEDIOL
lig 64
EDO
B
526 41,2-ETHANEDIOL
lig 65
EDO
B
527 41,2-ETHANEDIOL
lig 66
EDO
B
528 41,2-ETHANEDIOL
lig 67
EDO
B
529 41,2-ETHANEDIOL
lig 68
EDO
B
530 41,2-ETHANEDIOL
lig 69
EDO
B
531 41,2-ETHANEDIOL
lig 70
EDO
B
532 41,2-ETHANEDIOL
lig 71
EDO
B
533 41,2-ETHANEDIOL
lig 72
EDO
B
534 41,2-ETHANEDIOL
lig 73
EDO
B
535 41,2-ETHANEDIOL
lig 74
EDO
B
536 41,2-ETHANEDIOL
lig 75
EDO
B
537 41,2-ETHANEDIOL
lig 76
EDO
B
538 41,2-ETHANEDIOL
lig 77
PGE
B
539 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 78
SO4
B
540 5SULFATE ION
lig 79
SO4
B
541 5SULFATE ION
lig 80
EDO
B
542 41,2-ETHANEDIOL
lig 81
SO4
C
501 5SULFATE ION
lig 82
EDO
C
502 41,2-ETHANEDIOL
lig 83
HEC
C
503 43HEME C
lig 84
HEC
C
504 43HEME C
lig 85
HEC
C
505 43HEME C
lig 86
HEC
C
506 43HEME C
lig 87
HEC
C
507 43HEME C
lig 88
SO4
C
508 5SULFATE ION
lig 89
SO4
C
509 5SULFATE ION
lig 90
SO4
C
510 5SULFATE ION
lig 91
SO4
C
511 5SULFATE ION
lig 92
SO4
C
512 5SULFATE ION
lig 93
SO4
C
513 5SULFATE ION
lig 94
SO4
C
514 5SULFATE ION
lig 95
EDO
C
515 41,2-ETHANEDIOL
lig 96
EDO
C
516 41,2-ETHANEDIOL
lig 97
EDO
C
517 41,2-ETHANEDIOL
lig 98
EDO
C
518 41,2-ETHANEDIOL
lig 99
EDO
C
519 41,2-ETHANEDIOL
lig 100
EDO
C
520 41,2-ETHANEDIOL
lig 101
EDO
C
521 41,2-ETHANEDIOL
lig 102
EDO
C
522 41,2-ETHANEDIOL
lig 103
EDO
C
523 41,2-ETHANEDIOL
lig 104
EDO
C
524 41,2-ETHANEDIOL
lig 105
EDO
C
525 41,2-ETHANEDIOL
lig 106
EDO
C
526 41,2-ETHANEDIOL
lig 107
EDO
C
527 41,2-ETHANEDIOL
lig 108
EDO
C
528 41,2-ETHANEDIOL
lig 109
EDO
C
529 41,2-ETHANEDIOL
lig 110
EDO
C
530 41,2-ETHANEDIOL
lig 111
EDO
C
531 41,2-ETHANEDIOL
lig 112
EDO
C
532 41,2-ETHANEDIOL
lig 113
EDO
D
501 41,2-ETHANEDIOL
lig 114
SO4
D
502 5SULFATE ION
lig 115
EDO
D
503 41,2-ETHANEDIOL
lig 116
EDO
D
504 41,2-ETHANEDIOL
lig 117
HEC
D
505 43HEME C
lig 118
HEC
D
506 43HEME C
lig 119
HEC
D
507 43HEME C
lig 120
HEC
D
508 43HEME C
lig 121
HEC
D
509 43HEME C
lig 122
SO4
D
510 5SULFATE ION
lig 123
SO4
D
511 5SULFATE ION
lig 124
SO4
D
512 5SULFATE ION
lig 125
SO4
D
513 5SULFATE ION
lig 126
SO4
D
514 5SULFATE ION
lig 127
EDO
D
515 41,2-ETHANEDIOL
lig 128
EDO
D
516 41,2-ETHANEDIOL
lig 129
EDO
D
517 41,2-ETHANEDIOL
lig 130
EDO
D
518 41,2-ETHANEDIOL
lig 131
EDO
D
519 41,2-ETHANEDIOL
lig 132
EDO
D
520 41,2-ETHANEDIOL
lig 133
EDO
D
521 41,2-ETHANEDIOL
lig 134
EDO
D
522 41,2-ETHANEDIOL
lig 135
EDO
D
523 41,2-ETHANEDIOL
lig 136
EDO
D
524 41,2-ETHANEDIOL
lig 137
EDO
D
525 41,2-ETHANEDIOL
lig 138
EDO
D
526 41,2-ETHANEDIOL
lig 139
EDO
D
527 41,2-ETHANEDIOL
lig 140
EDO
D
528 41,2-ETHANEDIOL
lig 141
EDO
D
529 41,2-ETHANEDIOL
lig 142
PGE
D
530 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 143
EDO
D
531 41,2-ETHANEDIOL
lig 144
EDO
D
532 41,2-ETHANEDIOL
lig 145
EDO
D
533 41,2-ETHANEDIOL