Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
9YPM


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 74 ligands in PDB entry 9YPM. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
SO4
A
301 5SULFATE ION
lig 2
SO4
A
302 5SULFATE ION
lig 3
SO4
A
303 5SULFATE ION
lig 4
SO4
A
304 5SULFATE ION
lig 5
CL
A
305 1CHLORIDE ION
lig 6
CL
A
306 1CHLORIDE ION
lig 7
CL
A
307 1CHLORIDE ION
lig 8
CL
A
308 1CHLORIDE ION
lig 9
FE2
A
309 1FE (II) ION
lig 10
FE2
A
310 1FE (II) ION
lig 11
GOL
A
311 6GLYCEROL
lig 12
GOL
A
312 6GLYCEROL
lig 13
GOL
A
313 6GLYCEROL
lig 14
GOL
A
314 6GLYCEROL
lig 15
GOL
A
315 6GLYCEROL
lig 16
GOL
A
316 6GLYCEROL
lig 17
GOL
A
317 6GLYCEROL
lig 18
GOL
A
318 6GLYCEROL
lig 19
GOL
A
319 6GLYCEROL
lig 20
GOL
A
320 6GLYCEROL
lig 21
GOL
A
321 6GLYCEROL
lig 22
GOL
A
322 6GLYCEROL
lig 23
SO4
B
301 5SULFATE ION
lig 24
SO4
B
302 5SULFATE ION
lig 25
SO4
B
303 5SULFATE ION
lig 26
SO4
B
304 5SULFATE ION
lig 27
SO4
B
305 5SULFATE ION
lig 28
CL
B
306 1CHLORIDE ION
lig 29
CL
B
307 1CHLORIDE ION
lig 30
CL
B
308 1CHLORIDE ION
lig 31
CL
B
309 1CHLORIDE ION
lig 32
FE2
B
310 1FE (II) ION
lig 33
FE2
B
311 1FE (II) ION
lig 34
GOL
B
312 6GLYCEROL
lig 35
GOL
B
313 6GLYCEROL
lig 36
GOL
B
314 6GLYCEROL
lig 37
GOL
B
315 6GLYCEROL
lig 38
GOL
B
316 6GLYCEROL
lig 39
GOL
B
317 6GLYCEROL
lig 40
GOL
B
318 6GLYCEROL
lig 41
ACT
B
319 4ACETATE ION
lig 42
SO4
C
301 5SULFATE ION
lig 43
SO4
C
302 5SULFATE ION
lig 44
SO4
C
303 5SULFATE ION
lig 45
CL
C
304 1CHLORIDE ION
lig 46
CL
C
305 1CHLORIDE ION
lig 47
FE2
C
306 1FE (II) ION
lig 48
FE2
C
307 1FE (II) ION
lig 49
GOL
C
308 6GLYCEROL
lig 50
GOL
C
309 6GLYCEROL
lig 51
GOL
C
310 6GLYCEROL
lig 52
GOL
C
311 6GLYCEROL
lig 53
GOL
C
312 6GLYCEROL
lig 54
GOL
C
313 6GLYCEROL
lig 55
GOL
C
314 6GLYCEROL
lig 56
GOL
C
315 6GLYCEROL
lig 57
GOL
C
316 6GLYCEROL
lig 58
GOL
C
317 6GLYCEROL
lig 59
ACT
C
318 4ACETATE ION
lig 60
ACT
C
319 4ACETATE ION
lig 61
SO4
D
301 5SULFATE ION
lig 62
SO4
D
302 5SULFATE ION
lig 63
SO4
D
303 5SULFATE ION
lig 64
CL
D
304 1CHLORIDE ION
lig 65
CL
D
305 1CHLORIDE ION
lig 66
FE2
D
306 1FE (II) ION
lig 67
FE2
D
307 1FE (II) ION
lig 68
GOL
D
308 6GLYCEROL
lig 69
GOL
D
309 6GLYCEROL
lig 70
GOL
D
310 6GLYCEROL
lig 71
GOL
D
311 6GLYCEROL
lig 72
GOL
D
312 6GLYCEROL
lig 73
GOL
D
313 6GLYCEROL
lig 74
GOL
D
314 6GLYCEROL