3J7A | Ribosome Inhibitor | date | Jun 03, 2014 |
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title | Cryo-Em Structure Of The Plasmodium Falciparum 80s Ribosome The Anti-Protozoan Drug Emetine, Small Subunit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | W.Wong, X.C.Bai, A.Brown, I.S.Fernandez, E.Hanssen, M.Condron, Y.H J.Baum, S.H.W.Scheres | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 18s Ribosomal Rna Chain: A |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Es1 Chain: B |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Us2 Chain: C |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Us3 Chain: D |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Us4 Chain: E |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Es4 Chain: F |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Us5 Chain: G |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Es6 Chain: H |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Us7 Chain: I |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Es7 Chain: J |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Us8 Chain: K |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Es8 Chain: L |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Us9 Chain: M |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Us10 Chain: N |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Es10 Chain: O |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Us11 Chain: P |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Us12 Chain: Q |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Es12 Chain: R |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Us13 Chain: S |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Us14 Chain: T |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Us15 Chain: U |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Us17 Chain: V |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Es17 Chain: W |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Us19 Chain: X |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Es19 Chain: Y |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Es21 Chain: Z |
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Molecule: 40s Ribosomal Protein Es24 Chain: 1 |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Es25 Chain: 2 |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Es26 Chain: 3 |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Es27 Chain: 4 |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Es28 Chain: 5 |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Es30 Chain: 6 |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Trna Chain: 7 |
Organism_scientific: Plasmodium Falciparum Organism_taxid: 36329 Strain: 3d7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 1 |
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crystal cell |
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method | Electron Microscopy | resolution | 3.20 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | 34G, MG, ZN | enzyme |
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Gene Ontology |
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Primary reference | Cryo-EM structure of the Plasmodium falciparum 80S ribosome bound to the anti-protozoan drug emetine., Wong W, Bai XC, Brown A, Fernandez IS, Hanssen E, Condron M, Tan YH, Baum J, Scheres SH, Elife. 2014 Jun 9:e03080. doi: 10.7554/eLife.03080. PMID:24913268 |
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