3JAP | Translation | date | Jun 18, 2015 |
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title | Structure Of A Partial Yeast 48s Preinitiation Complex In Cl Conformation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | J.L.Llacer, T.Hussain, V.Ramakrishnan | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Met-Trnai (U31:A39 Variant) Chain: 1 Engineered: Yes |
Synthetic: Yes Organism_scientific: Kluyveromyces Lactis Organism_taxid: 28985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 18s Rrna Chain: 2 |
Organism_scientific: Kluyveromyces Lactis Organism_taxid: 28985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Mrna Chain: 3 Engineered: Yes |
Synthetic: Yes Organism_scientific: Synthetic Construct Organism_taxid: 32630 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Us2 Chain: A |
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Molecule: Es1 Chain: B |
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Molecule: Us5 Chain: C |
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Molecule: Us3 Chain: D |
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Molecule: Es4 Chain: E |
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Molecule: Us7 Chain: F |
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Molecule: Es6 Chain: G |
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Molecule: Es7 Chain: H |
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Molecule: Es8 Chain: I |
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Molecule: Us4 Chain: J |
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Molecule: Es10 Chain: K |
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Molecule: Us17 Chain: L |
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Molecule: Es12 Chain: M |
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Molecule: Us15 Chain: N |
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Molecule: Us11 Chain: O |
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Molecule: Us19 Chain: P |
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Molecule: Us9 Chain: Q |
Organism_scientific: Kluyveromyces Lactis Organism_taxid: 28985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Es17 Chain: R |
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Molecule: Us13 Chain: S |
Organism_scientific: Kluyveromyces Lactis Organism_taxid: 28985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Es19 Chain: T |
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Molecule: Us10 Chain: U |
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Molecule: Es21 Chain: V |
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Molecule: Us8 Chain: W |
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Molecule: Us12 Chain: X |
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Molecule: Es24 Chain: Y |
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Molecule: Es25 Chain: Z |
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Molecule: Es26 Chain: a |
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Molecule: Es27 Chain: b |
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Molecule: Es28 Chain: c |
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Molecule: Us14 Chain: d |
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Molecule: Es30 Chain: e |
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Molecule: Es31 Chain: f |
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Molecule: Rack1 Chain: g |
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Molecule: El41 Chain: h |
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Molecule: Eif1a Chain: I Engineered: Yes |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Yeast Organism_taxid: 4932 Expression_system: Escherichia Coli Bl21 Expression_system_taxid: 511693 Expression_system_strain: Rosetta Expression_system_vector_type: Plasmid Expression_system_plasmid: Ptyb2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Eif2 Alpha Chain: j Engineered: Yes |
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Molecule: Eif2 Gamma Chain: k Engineered: Yes |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Yeast Organism_taxid: 4932 Expression_system: Saccharomyces Cerevisiae Expression_system_common: Yeast Expression_system_taxid: 4932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Eif2 Beta Chain: l Engineered: Yes |
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Molecule: Eif1 Chain: m Engineered: Yes |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Yeast Organism_taxid: 4932 Expression_system: Escherichia Coli Bl21 Expression_system_taxid: 511693 Expression_system_strain: Rosetta Expression_system_vector_type: Plasmid Expression_system_plasmid: Ptyb2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Eif3a Chain: o Engineered: Yes |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Yeast Organism_taxid: 4932 Expression_system: Saccharomyces Cerevisiae Expression_system_common: Yeast Expression_system_taxid: 4932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Eif3c Chain: p Engineered: Yes |
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Molecule: Eif3i Chain: q Engineered: Yes |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Yeast Organism_taxid: 4932 Expression_system: Saccharomyces Cerevisiae Expression_system_common: Yeast Expression_system_taxid: 4932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Eif3b Chain: r Engineered: Yes |
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Molecule: Eif3g Chain: s Engineered: Yes |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Yeast Organism_taxid: 4932 Expression_system: Saccharomyces Cerevisiae Expression_system_common: Yeast Expression_system_taxid: 4932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 1 |
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crystal cell |
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method | Electron Microscopy | resolution | 4.90 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | GCP, MET, MG, ZN | enzyme |
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Gene Ontology |
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Primary reference | Conformational Differences between Open and Closed States of the Eukaryotic Translation Initiation Complex., Llacer JL, Hussain T, Marler L, Aitken CE, Thakur A, Lorsch JR, Hinnebusch AG, Ramakrishnan V, Mol Cell. 2015 Aug 6;59(3):399-412. doi: 10.1016/j.molcel.2015.06.033. Epub 2015 , Jul 23. PMID:26212456 |
OCA© by Jaime Prilusky, 1996-2014,2022 Bioinformatics Unit Weizmann Institute of Science |