4B3S | Ribosome | date | Jul 26, 2012 |
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title | Crystal Structure Of The 30s Ribosome In Complex With Compou | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | C.L.Ng, K.Lang, D.Shcherbakov, T.Matt, D.Perez-Fernandez, R.Patak S.Duscha, R.Akbergenov, H.Boukari, P.Freihofer, I.Kudyba, M.S.K. R.S.Nandurikar, V.Ramakrishnan, A.Vasella, E.C.Bottger | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 16s Ribosomal Rna Chain: A |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S2 Chain: B |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S3 Chain: C |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S4 Chain: D |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S5 Chain: E |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S6 Chain: F Synonym: Ts9 |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S7 Chain: G |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S8 Chain: H |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S9 Chain: I |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S10 Chain: J |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S11 Chain: K |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S12 Chain: L |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S13 Chain: M |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S14 Type Z Chain: N |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S15 Chain: O |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S16 Chain: P |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S17 Chain: Q |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S18 Chain: R |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S19 Chain: S |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S20 Chain: T |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein Thx Chain: V |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 5'-R(Upupcpapapap)-3' Chain: W Synonym: Mrna |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 5'-R(Gpgpgpapupupgpapapapapupcpcpc Chain: Z Synonym: Anticodon Stem Loop Asl |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Hb8 Organism_taxid: 300852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 41 21 2 |
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crystal cell |
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method | X-Ray Diffraction | resolution | 3.15 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | K, MG, RPO, ZN | enzyme |
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Gene Ontology |
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Primary reference | 4'-O-substitutions determine selectivity of aminoglycoside antibiotics., Perez-Fernandez D, Shcherbakov D, Matt T, Leong NC, Kudyba I, Duscha S, Boukari H, Patak R, Dubbaka SR, Lang K, Meyer M, Akbergenov R, Freihofer P, Vaddi S, Thommes P, Ramakrishnan V, Vasella A, Bottger EC, Nat Commun. 2014 Jan 28;5:3112. doi: 10.1038/ncomms4112. PMID:24473108 |
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