5K0Y | Translation | date | May 17, 2016 |
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title | M48s Late-Stage Initiation Complex, Purified From Rabbit Ret Lysates, Displaying Eif2 Ternary Complex And Eif3 I And G S Relocated To The Intersubunit Face | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | A.Simonetti, J.Brito Querido, A.G.Myasnikov, E.Mancera-Martinez A.Renaud, L.Kuhn, Y.Hashem | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Trna Chain: N Engineered: Yes Other_details: Trnaimet |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 18s Ribosomal Rna Chain: A Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Mrna Chain: F Engineered: Yes Other_details: Beta-Globin Mrna |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Eukaryotic Translation Initiation Factor 2 Subuni Chain: P Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Eif2s1 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Us17 Chain: G Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Loc100347468 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Us9 Chain: H Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Rps16 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S4 Chain: I Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Rps4x Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Us14 Chain: J Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Loc100337712 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S9 (Predicted) Chain: K Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Rps9 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Us13 Chain: L Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Rps18 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Eukaryotic Translation Initiation Factor 3 Subuni Chain: M Synonym: Eif3g,Eukaryotic Translation Initiation Factor 3 R Subunit,Eif-3 Rna-Binding Subunit,Eukaryotic Translation In Factor 3 Subunit 4,Eif-3-Delta,Eif3 P42,Eif3 P44; Engineered: Yes |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 Gene: Eif3g, Eif3s4 Expression_system: Homo Sapiens Expression_system_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Eukaryotic Translation Initiation Factor 3 Subuni Chain: O Synonym: Eif3g,Eukaryotic Translation Initiation Factor 3 R Subunit,Eif-3 Rna-Binding Subunit,Eukaryotic Translation In Factor 3 Subunit 4,Eif-3-Delta,Eif3 P42,Eif3 P44; Engineered: Yes |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 Gene: Eif3g, Eif3s4 Expression_system: Homo Sapiens Expression_system_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Us12 Chain: Q Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Es19 Chain: R Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Loc100345774 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Eukaryotic Initiation Factor 2 Gamma Subunit (Eif Chain: S Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Eukaryotic Translation Initiation Factor 3 Subuni Chain: T Synonym: Eif3i,Eukaryotic Translation Initiation Factor 3 S Eif-3-Beta,Eif3 P36; Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Eif3i, Eif3s2 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Us7 Chain: U Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Rps5 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Es30 Chain: V Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Fau Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Es25 Chain: W Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Rps25 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Es7 Chain: X Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Rps7 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S27 Chain: Y Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Rps27 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Us15 Chain: Z Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Rps13 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Us8 Chain: a Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Rps15a Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S21 Chain: b Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Rps21 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Us5 Chain: c Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_taxid: 9986 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Eukaryotic Initiation Factor 2 Subunit Beta (Eif2 Chain: d Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_taxid: 9986 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Es17 Chain: e Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Rps17 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Us2 Chain: f Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_taxid: 9986 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Us3 Chain: g Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_taxid: 9986 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Us10 Chain: h Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_taxid: 9986 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Es1 Chain: I Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Rps3a Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Us11 Chain: j Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_taxid: 9986 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Es26 Chain: k Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Rps26 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Es28 Chain: l Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Rps28 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Rack1 Chain: m Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Gnb2l1 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Us19 Chain: n Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Loc103349305 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S8 Chain: o Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Rps8 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Es31 Chain: p Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Loc100348379 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S6 Chain: q Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Loc100339133, Rps6 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S12 Chain: r Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Rps12 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S24 Chain: s Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Rps24 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Es10 Chain: t Engineered: Yes |
Organism_scientific: Oryctolagus Cuniculus Organism_common: Rabbit Organism_taxid: 9986 Gene: Rps10 Expression_system: Oryctolagus Cuniculus Expression_system_taxid: 9986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 1 |
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crystal cell |
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method | Electron Microscopy | resolution | 5.80 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
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Primary reference | eIF3 Peripheral Subunits Rearrangement after mRNA Binding and Start-Codon Recognition., Simonetti A, Brito Querido J, Myasnikov AG, Mancera-Martinez E, Renaud A, Kuhn L, Hashem Y, Mol Cell. 2016 Jun 29. pii: S1097-2765(16)30197-6. doi:, 10.1016/j.molcel.2016.05.033. PMID:27373335 |
OCA© by Jaime Prilusky, 1996-2014,2022 Bioinformatics Unit Weizmann Institute of Science |