1KQS | Ribosome | date | Jan 07, 2002 |
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title | The Haloarcula Marismortui 50s Complexed With A Pretransloca Intermediate In Protein Synthesis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | T.M.Schmeing, A.C.Seila, J.L.Hansen, B.Freeborn, J.K.Soukup, S.A. S.A.Strobel, P.B.Moore, T.A.Steitz | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 23s Rrna Chain |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 5s Rrna Chain: 9 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cca Chain: 3 Engineered: Yes Other_details: Rna Analogue Of 3' Of Deacylated-Trna |
Synthetic: Yes Other_details: Solid Phase Synthesis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cc-Pmn-Pcb Chain: 4 Engineered: Yes Other_details: An Analogue Of Peptidyl-Trna Contains Puromy Monophosphate, Phenylalaninal, 6-Aminohexanoic Acid, And Bi |
Synthetic: Yes Other_details: Solid Phase Synthesis, Followed By Peptidyl Transferase Reaction.; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L2 Chain: A Synonym: 50s Ribosomal Protein L2p, Hmal2, Hl4 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L3 Chain: B Synonym: 50s Ribosomal Protein L3p, Hmal3, Hl1 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L4 Chain: C Synonym: 50s Ribosomal Protein L4e, Hmal4, Hl6 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L5 Chain: D Synonym: 50s Ribosomal Protein L5p, Hmal5, Hl13 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L6 Chain: E Synonym: 50s Ribosomal Protein L6p, Hmal6, Hl10 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L7ae Chain: F Synonym: 30s Ribosomal Protein Hs6 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L10 Chain: G Synonym: 50s Ribosomal Protein P0, Hmal10, L10e |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L10e Chain: H |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L13 Chain: I Synonym: 50s Ribosomal Protein L13p, Hmal13 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L14 Chain: J Synonym: 50s Ribosomal Protein L14p, Hmal14, Hl27 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L15 Chain: K Synonym: 50s Ribosomal Protein L15p, Hmal15, Hl9 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L15e Chain: L |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L18 Chain: M Synonym: 50s Ribosomal Protein L18p, Hmal18, Hl12 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L18e Chain: N Synonym: 50s Ribosomal Protein L18e, Hl29, L19 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L19e Chain: O Synonym: 50s Ribosomal Protein L19e, Hmal19, Hl24 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L21e Chain: P Synonym: 50s Ribosomal Protein L21e, Hl31 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L22 Chain: Q Synonym: 50s Ribosomal Protein L22p, Hmal22, Hl23 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L23 Chain: R Synonym: 50s Ribosomal Protein L23p, Hmal23, Hl25, L21 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L24 Chain: S Synonym: 50s Ribosomal Protein L24p, Hmal24, Hl16, Hl15 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L24e Chain: T Synonym: 50s Ribosomal Protein L24e, Hl21hl22 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L29 Chain: U Synonym: 50s Ribosomal Protein L29p, Hmal29, Hl33 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L30 Chain: V Synonym: 50s Ribosomal Protein L30p, Hmal30, Hl20, Hl16 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L31e Chain: W Synonym: 50s Ribosomal Protein L31e, L34, Hl30 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L32e Chain: X Synonym: 50s Ribosomal Protein L32e, Hl5 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L37ae Chain: Y |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L37e Chain: Z Synonym: 50s Ribosomal Protein L37e, L35e |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L39e Chain: 1 Synonym: 50s Ribosomal Proteins L39e, Hl39e, Hl46e |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein L44e Chain: 2 Synonym: 50s Ribosomal Protein L44e, La, Hla |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: C 2 2 21 |
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crystal cell |
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method | X-Ray Diffraction | resolution | 3.10 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | ACA, BTN, CD, CL, K, MG, NA, PHA, PPU | enzyme |
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Gene Ontology |
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Primary reference | A pre-translocational intermediate in protein synthesis observed in crystals of enzymatically active 50S subunits., Schmeing TM, Seila AC, Hansen JL, Freeborn B, Soukup JK, Scaringe SA, Strobel SA, Moore PB, Steitz TA, Nat Struct Biol 2002 Mar;9(3):225-30. PMID:11828326 |
OCA© by Jaime Prilusky, 1996-2014,2022 Bioinformatics Unit Weizmann Institute of Science |