1Q81 | Ribosome | date | Aug 20, 2003 |
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title | Crystal Structure Of Minihelix With 3' Puromycin Bound To A- The 50s Ribosomal Subunit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | J.L.Hansen, T.M.Schmeing, P.B.Moore, T.A.Steitz | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 23s Ribosomal Rna Chain: A |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 5s Ribosomal Rna Chain: B |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Minihelix-Puromycin Chain: 5 Engineered: Yes Other_details: A-Substrate Analogue Contains Puromycin-5'- Monophosphate; |
Synthetic: Yes Other_details: Minihelix-Puromycin Synthesized By Dharmacon Pharmaceuticals; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L2p Chain: C Synonym: Hmal2, Hl4 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L3p Chain: D Synonym: Hmal3, Hl1 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L4e Chain: E Synonym: Hmal4, Hl6 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L5p Chain: F Synonym: Hmal5, Hl13 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L6p Chain: G Synonym: Hmal6, Hl10 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L7ae Chain: H Synonym: Hs6 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Acidic Ribosomal Protein P0 Homolog Chain: I Synonym: L10e, Hmal10 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: L10 Ribosomal Protein Chain: J |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L13p Chain: K |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L14p Chain: L Synonym: Hmal13 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L15p Chain: M Synonym: Hmal15, Hl9 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: L15 Ribosomal Protein Chain: N |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L18p Chain: O Synonym: Hmal18, Hl12 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L18e Chain: P Synonym: Hl29, L19 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L19e Chain: Q Synonym: Hmal19, Hl24 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L21e Chain: R Synonym: Hl31 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L22p Chain: S Synonym: Hmal22, Hl23 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L23p Chain: T Synonym: Hmal23, Hl25, L21 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L24p Chain: U Synonym: Hmal24, Hl16, Hl15 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L24e Chain: V Synonym: Hl21hl22 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L29p Chain: W Synonym: Hmal29, Hl33 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L30p Chain: X Synonym: Hmal30, Hl20, Hl16 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L31e Chain: Y Synonym: L34, Hl30 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L32e Chain: Z Synonym: Hl5 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: L37ae 50s Ribosomal Protein Chain: 1 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L37e Chain: 2 Synonym: L35e |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L39e Chain: 3 Synonym: Hl39e, Hl46e |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L44e Chain: 4 Synonym: La, Hla |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: C 2 2 21 |
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crystal cell |
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method | X-Ray Diffraction | resolution | 2.95 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | CD, CL, K, MG, NA, PPU | enzyme |
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related structures | by homologous chain: 1Q82, 1QVG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
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Primary reference | Structural insights into peptide bond formation., Hansen JL, Schmeing TM, Moore PB, Steitz TA, Proc Natl Acad Sci U S A 2002 Sep 3;99(18):11670-5. PMID:12185246 |
OCA© by Jaime Prilusky, 1996-2014,2022 Bioinformatics Unit Weizmann Institute of Science |