1YHQ | Ribosome | date | Jan 10, 2005 |
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title | Crystal Structure Of Azithromycin Bound To The G2099a Mutant Ribosomal Subunit Of Haloarcula Marismortui | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | D.Tu, G.Blaha, P.B.Moore, T.A.Steitz | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 23s Ribosomal Rna Chain Mutation: Yes Other_details: Encoded By Rrna Operon |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 5s Ribosomal Rna Chain: 9 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L2p Chain: A |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L3p Chain: B |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L4e Chain: C |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L5p Chain: D |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L6p Chain: E |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L7ae Chain: F |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Acidic Ribosomal Protein P0 Homolog Chain: G |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L10e Chain: H |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L11p Chain: I |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L13p Chain: J |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L14p Chain: K |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L15p Chain: L |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L15e Chain: M |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L18p Chain: N |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L18e Chain: O |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L19e Chain: P |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L21e Chain: Q |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L22p Chain: R |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L23p Chain: S |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L24p Chain: T |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L24e Chain: U |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L29p Chain: V |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L30p Chain: W |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L31e Chain: X |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L32e Chain: Y |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L37ae Chain: Z |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L37e Chain: 1 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L39e Chain: 2 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L44e Chain: 3 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: C 2 2 21 |
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crystal cell |
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method | X-Ray Diffraction | resolution | 2.40 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | 1MA, CD, CL, K, MG, NA, OMG, OMU, PSU, SR, UR3, ZIT | enzyme |
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related structures | by homologous chain: 1JJ2, 1S72, 1YIJ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
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Primary reference | Structures of MLSBK antibiotics bound to mutated large ribosomal subunits provide a structural explanation for resistance., Tu D, Blaha G, Moore PB, Steitz TA, Cell. 2005 Apr 22;121(2):257-70. PMID:15851032 |
OCA© by Jaime Prilusky, 1996-2014,2022 Bioinformatics Unit Weizmann Institute of Science |