1VQ6 | Ribosome | date | Dec 16, 2004 |
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title | The Structure Of C-Hpmn And Cca-Phe-Cap-Bio Bound To The Lar Ribosomal Subunit Of Haloarcula Marismortui | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | T.M.Schmeing, T.A.Steitz | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 23s Ribosomal Rna Chain |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 5s Ribosomal Rna Chain: 9 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 5'-R(Cp(5aa)(Hfa))-3' Chain: 4 Engineered: Yes |
Synthetic: Yes Other_details: Cytidine-Hydroxypuromycin Oligomer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 5'-R(Cpcpap(Phe)(Aca)(Btn))-3' Chain: 5 Engineered: Yes |
Synthetic: Yes Other_details: Cca-Phe-Caproic Acid Biotin Oligomer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L2p Chain: A |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L3p Chain: B |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L4e Chain: C |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L5p Chain: D |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L6p Chain: E |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L7ae Chain: F |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Acidic Ribosomal Protein P0 Homolog Chain: G |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L10e Chain: H |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L13p Chain: J |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L14p Chain: K |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L15p Chain: L |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L15e Chain: M |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L18p Chain: N |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L18e Chain: O |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L19e Chain: P |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L21e Chain: Q |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L22p Chain: R |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L23p Chain: S |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L24p Chain: T |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L24e Chain: U |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L29p Chain: V |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L30p Chain: W |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L31e Chain: X |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L32e Chain: Y |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L37ae Chain: Z |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L37e Chain: 1 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L39e Chain: 2 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L44e Chain: 3 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L11p Chain: I |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: C 2 2 21 |
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crystal cell |
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method | X-Ray Diffraction | resolution | 2.70 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | 1MA, 5AA, ACA, BTN, CD, CL, HFA, K, MG, NA, OMG, OMU, PSU, UR3 | enzyme |
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Gene Ontology |
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Primary reference | An induced-fit mechanism to promote peptide bond formation and exclude hydrolysis of peptidyl-tRNA., Schmeing TM, Huang KS, Strobel SA, Steitz TA, Nature. 2005 Nov 24;438(7067):520-4. PMID:16306996 |
OCA© by Jaime Prilusky, 1996-2014,2022 Bioinformatics Unit Weizmann Institute of Science |