5GJQ | Hydrolase | date | Jul 01, 2016 |
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title | Structure Of The Human 26s Proteasome Bound To Usp14-Ubal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | X.L.Huang, B.Luan, J.P.Wu, Y.G.Shi | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Beta Type-6 Chain: a, o Synonym: Macropain Delta Chain,Multicatalytic Endopeptidase Delta Chain,Proteasome Delta Chain,Proteasome Subunit Y; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Alpha Type-6 Chain: B, h Synonym: 27 Kda Prosomal Protein,P27k,Macropain Iota Chain, Multicatalytic Endopeptidase Complex Iota Chain,Proteasome Chain; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Beta Type-7 Chain: b, p Synonym: Macropain Chain Z,Multicatalytic Endopeptidase Com Z,Proteasome Subunit Z; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Alpha Type-2 Chain: C, I Synonym: Macropain Subunit C3,Multicatalytic Endopeptidase Subunit C3,Proteasome Component C3; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Beta Type-3 Chain: c, q Synonym: Proteasome Chain 13,Proteasome Component C10-II,Pr Theta Chain; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Alpha Type-4 Chain: D, j Synonym: Macropain Subunit C9,Multicatalytic Endopeptidase Subunit C9,Proteasome Component C9,Proteasome Subunit L; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Beta Type-2 Chain: d, r Synonym: Macropain Subunit C7-I,Multicatalytic Endopeptidas Subunit C7-I,Proteasome Component C7-I; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Alpha Type-7 Chain: E, k Synonym: Proteasome Subunit Rc6-1,Proteasome Subunit Xapc7 Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Beta Type-5 Chain: e, s Synonym: Macropain Epsilon Chain,Multicatalytic Endopeptida Epsilon Chain,Proteasome Chain 6,Proteasome Epsilon Chain,P Subunit Mb1,Proteasome Subunit X; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Alpha Type-5 Chain: F, l Synonym: Macropain Zeta Chain,Multicatalytic Endopeptidase Zeta Chain,Proteasome Zeta Chain; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Beta Type-1 Chain: f, t Synonym: Macropain Subunit C5,Multicatalytic Endopeptidase Subunit C5,Proteasome Component C5,Proteasome Gamma Chain; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Alpha Type-1 Chain: G, m Synonym: 30 Kda Prosomal Protein,Pros-30,Macropain Subunit Multicatalytic Endopeptidase Complex Subunit C2,Proteasome C2,Proteasome Nu Chain; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Beta Type-4 Chain: g, u Synonym: 26 Kda Prosomal Protein,Pros-26,Macropain Beta Cha Multicatalytic Endopeptidase Complex Beta Chain,Proteasome Chain,Proteasome Chain 3,Hsn3; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Protease Regulatory Subunit 7 Chain: H Synonym: 26s Proteasome Aaa-Atpase Subunit Rpt1,Proteasome Subunit Atpase 2,Protein Mss1; |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Protease Regulatory Subunit 4 Chain: I Synonym: P26s4,26s Proteasome Aaa-Atpase Subunit Rpt2,Prote Subunit Atpase 1; |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Protease Regulatory Subunit 8 Chain: J Synonym: 26s Proteasome Aaa-Atpase Subunit Rpt6,Proteasome Subunit Atpase 5,Proteasome Subunit P45,Thyroid Hormone Rec Interacting Protein 1,Trip1,P45sug; |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Protease Regulatory Subunit 6b Chain: K Synonym: 26s Proteasome Aaa-Atpase Subunit Rpt3,Mb67-Intera Protein,Mip224,Proteasome 26s Subunit Atpase 4,Tat-Binding Tbp-7; |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Protease Regulatory Subunit 10b Chain: L Synonym: 26s Proteasome Aaa-Atpase Subunit Rpt4,Proteasome Subunit Atpase 6,Proteasome Subunit P42; |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Protease Regulatory Subunit 6a Chain: M Synonym: 26s Proteasome Aaa-Atpase Subunit Rpt5,Proteasome Subunit Atpase 3,Proteasome Subunit P50,Tat-Binding Protein |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Non-Atpase Regulatory Subunit 1 Chain: N Synonym: 26s Proteasome Regulatory Subunit Rpn2,26s Proteas Regulatory Subunit S1,26s Proteasome Subunit P112; |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Alpha Type-3 Chain: n, X Synonym: Macropain Subunit C8,Multicatalytic Endopeptidase Subunit C8,Proteasome Component C8; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Non-Atpase Regulatory Subunit 13 Chain: O Synonym: 26s Proteasome Regulatory Subunit Rpn9,26s Proteas Regulatory Subunit S11,26s Proteasome Regulatory Subunit P4 |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Non-Atpase Regulatory Subunit 12 Chain: P Synonym: 26s Proteasome Regulatory Subunit Rpn5,26s Proteas Regulatory Subunit P55; |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Non-Atpase Regulatory Subunit 11 Chain: Q Synonym: 26s Proteasome Regulatory Subunit Rpn6,26s Proteas Regulatory Subunit S9,26s Proteasome Regulatory Subunit P44 |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Non-Atpase Regulatory Subunit 6 Chain: R Synonym: 26s Proteasome Regulatory Subunit Rpn7,26s Proteas Regulatory Subunit S10,Breast Cancer-Associated Protein Sga Phosphonoformate Immuno-Associated Protein 4,Proteasome Reg Particle Subunit P44s10,P42a; |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Non-Atpase Regulatory Subunit 3 Chain: S Synonym: 26s Proteasome Regulatory Subunit Rpn3,26s Proteas Regulatory Subunit S3,Proteasome Subunit P58; |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Non-Atpase Regulatory Subunit 8 Chain: T Synonym: 26s Proteasome Regulatory Subunit Rpn12,26s Protea Regulatory Subunit S14,P31; |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Non-Atpase Regulatory Subunit 7 Chain: U Synonym: 26s Proteasome Regulatory Subunit Rpn8,26s Proteas Regulatory Subunit S12,Mov34 Protein Homolog,Proteasome Sub |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Non-Atpase Regulatory Subunit 14 Chain: V Synonym: 26s Proteasome Regulatory Subunit Rpn11,26s Protea Associated Pad1 Homolog 1; Ec: 3.4.19.- |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Non-Atpase Regulatory Subunit 4 Chain: W Synonym: 26s Proteasome Regulatory Subunit Rpn10,26s Protea Regulatory Subunit S5a,Antisecretory Factor 1,Asf,Multiubiq Chain-Binding Protein; |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Complex Subunit Dss1 Chain: Y Synonym: Deleted In Split Handsplit Foot Protein 1,Split H Deleted Protein 1,Split Handfoot Malformation Type 1 Prote |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Non-Atpase Regulatory Subunit 2 Chain: Z Synonym: 26s Proteasome Regulatory Subunit Rpn1,26s Proteas Regulatory Subunit S2,26s Proteasome Subunit P97,Protein 55 Necrosis Factor Type 1 Receptor-Associated Protein 2; |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ubiquitin Carboxyl-Terminal Hydrolase 14 Chain: x Synonym: Deubiquitinating Enzyme 14,Ubiquitin Thioesterase Ubiquitin-Specific-Processing Protease 14; Ec: 3.4.19.12 Engineered: Yes |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 Gene: Usp14, Tgt Expression_system: Escherichia Coli K-12 Expression_system_taxid: 83333 Expression_system_strain: K-12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Polyubiquitin-B Chain: y Fragment: Unp Residues 1-76 Engineered: Yes |
Organism_scientific: Homo Sapiens Organism_common: Human Organism_taxid: 9606 Gene: Ubb Expression_system: Escherichia Coli Expression_system_taxid: 562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 1 |
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crystal cell |
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method | Electron Microscopy | resolution | 4.50 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | ADP, GLZ | enzyme | Hydrolase E.C.3.4.25.1 BRENDA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
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Primary reference | An atomic structure of the human 26S proteasome., Huang X, Luan B, Wu J, Shi Y, Nat Struct Mol Biol. 2016 Jul 18. doi: 10.1038/nsmb.3273. PMID:27428775 |
OCA© by Jaime Prilusky, 1996-2014,2022 Bioinformatics Unit Weizmann Institute of Science |