5HL7 | Ribosome | date | Jan 14, 2016 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
title | The Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit Of Stap Aureus In Complex With Lefamulin | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | Z.Eyal, D.Matzov, M.Krupkin, H.Rozenberg, E.Zimmerman, A.Bashan, A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L2 Chain: A |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 23s Ribosomal Rna Chain: X |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 5s Ribosomal Rna Chain: Y |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L3 Chain: B |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L4 Chain: C |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L5 Chain: D |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L6 Chain: E |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L13 Chain: G |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L14 Chain: H |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L15 Chain: I |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L16 Chain: J |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L17 Chain: K |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L18 Chain: L |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L19 Chain: M |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L20 Chain: N |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L21 Chain: O |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L22 Chain: P |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L23 Chain: Q |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L24 Chain: R |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L25 Chain: S Synonym: General Stress Protein Ctc |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L27 Chain: T |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L28 Chain: U |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L29 Chain: V |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L30 Chain: W |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L32 Chain: Z |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L34 Chain: 2 |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L35 Chain: 3 |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L36 Chain: 4 |
Organism_scientific: Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nc Organism_taxid: 93061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 65 2 2 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
crystal cell |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
method | X-Ray Diffraction | resolution | 3.55 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | 62B, EOH, EPE, MG, MN, MPD, SPD | enzyme |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary reference | A novel pleuromutilin antibacterial compound, its binding mode and selectivity mechanism., Eyal Z, Matzov D, Krupkin M, Paukner S, Riedl R, Rozenberg H, Zimmerman E, Bashan A, Yonath A, Sci Rep. 2016 Dec 13;6:39004. doi: 10.1038/srep39004. PMID:27958389 |
Data retrieval |
View 5HL7 in 3D |
Visual 3D analysis of 5HL7 |
Structure-derived information |
Sequence-derived information |
Other resources with information on 5HL7 |
OCA© by Jaime Prilusky, 1996-2014,2022 Bioinformatics Unit Weizmann Institute of Science |