5M3F | Transcription | date | Oct 14, 2016 |
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title | Yeast Rna Polymerase I Elongation Complex At 3.8a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | S.Neyer, M.Kunz, C.Geiss, M.Hantsche, V.V.Hodirnau, A.Seybert, C. M.P.Scheffer, P.Cramer, A.S.Frangakis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa190 Chain: A Synonym: Dna-Directed Rna Polymerase I 190 Kda Polypeptide, Directed Rna Polymerase I Largest Subunit; Ec: 2.7.7.6 |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa135 Chain: B Synonym: Dna-Directed Rna Polymerase I 135 Kda Polypeptide, Directed Rna Polymerase I Polypeptide 2,Rna Polymerase I Su Ec: 2.7.7.6 |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I And III Subunit Rp Chain: C Synonym: Rna Polymerases I And III Subunit Ac1,C37,Dna-Dire Polymerases I And III 40 Kda Polypeptide,C40; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: E Synonym: Rna Polymerases I,II,And III Subunit Abc1,Abc27,Dn Rna Polymerases I,And III 27 Kda Polypeptide; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: F Synonym: Rna Polymerases I,II,And III Subunit Abc2,Abc23,Dn Rna Polymerases I,And III 23 Kda Polypeptide; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: H Synonym: Rna Polymerases I,II,And III Subunit Abc3,Abc14.4, Dna-Directed Rna Polymerases I,And III 14.5 Kda Polypeptide |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa12 Chain: I Synonym: A12,A12.2,Dna-Directed Rna Polymerase I 13.7 Kda Polypeptide; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: J Synonym: Rna Polymerases I,II,And III Subunit Abc5,Abc10-Be Dna-Directed Rna Polymerases I,And III 8.3 Kda Polypeptide; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I And III Subunit Rp Chain: K Synonym: Rna Polymerases I And III Subunit Ac2,Ac19,Dna-Dir Polymerases I And III 16 Kda Polypeptide,Rpa19; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: L Synonym: Rna Polymerases I,II,And III Subunit Abc4,Abc10-Al |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Template Dna Chain: T Engineered: Yes |
Synthetic: Yes Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_taxid: 4932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Non-Template Dna Chain: U Engineered: Yes |
Synthetic: Yes Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_taxid: 4932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Rna Chain: R Engineered: Yes |
Synthetic: Yes Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_taxid: 4932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa49 Chain: M Synonym: A49,Dna-Directed Rna Polymerase I 49 Kda Polypepti |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa34 Chain: N Synonym: A34,Dna-Directed Dna-Dependent Rna Polymerase 34.5 Polypeptide,A34.5; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa14 Chain: D Synonym: A14,Dna-Directed Rna Polymerase I 14 Kda Polypepti |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa43 Chain: G Synonym: A43,Dna-Directed Dna-Dependent Rna Polymerase 36 K Polypeptide |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 1 |
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crystal cell |
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method | Electron Microscopy | resolution | 3.80 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | MG, SO4, ZN | enzyme | Transferase E.C.2.7.7.6 BRENDA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
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Primary reference | Structure of RNA polymerase I transcribing ribosomal DNA genes., Neyer S, Kunz M, Geiss C, Hantsche M, Hodirnau VV, Seybert A, Engel C, Scheffer MP, Cramer P, Frangakis AS, Nature. 2016 Nov 14. doi: 10.1038/nature20561. PMID:27842382 |
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